Protein–RNA interactions for Protein: Q96BY7

ATG2B, Autophagy-related protein 2 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 2,078 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG2BQ96BY7 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATG2BQ96BY7 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATG2BQ96BY7 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
ATG2BQ96BY7 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC22.02■■□□□ 1.11
ATG2BQ96BY7 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
ATG2BQ96BY7 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
ATG2BQ96BY7 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATG2BQ96BY7 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATG2BQ96BY7 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATG2BQ96BY7 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATG2BQ96BY7 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATG2BQ96BY7 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATG2BQ96BY7 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATG2BQ96BY7 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATG2BQ96BY7 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
ATG2BQ96BY7 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATG2BQ96BY7 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATG2BQ96BY7 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATG2BQ96BY7 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATG2BQ96BY7 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATG2BQ96BY7 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ATG2BQ96BY7 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ATG2BQ96BY7 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ATG2BQ96BY7 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ATG2BQ96BY7 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ATG2BQ96BY7 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ATG2BQ96BY7 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ATG2BQ96BY7 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ATG2BQ96BY7 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC22■■□□□ 1.11
ATG2BQ96BY7 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ATG2BQ96BY7 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ATG2BQ96BY7 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ATG2BQ96BY7 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
ATG2BQ96BY7 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ATG2BQ96BY7 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC22■■□□□ 1.11
ATG2BQ96BY7 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATG2BQ96BY7 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATG2BQ96BY7 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATG2BQ96BY7 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
ATG2BQ96BY7 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATG2BQ96BY7 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATG2BQ96BY7 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATG2BQ96BY7 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATG2BQ96BY7 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATG2BQ96BY7 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATG2BQ96BY7 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATG2BQ96BY7 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
ATG2BQ96BY7 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATG2BQ96BY7 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATG2BQ96BY7 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATG2BQ96BY7 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
ATG2BQ96BY7 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATG2BQ96BY7 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATG2BQ96BY7 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATG2BQ96BY7 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATG2BQ96BY7 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATG2BQ96BY7 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATG2BQ96BY7 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATG2BQ96BY7 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATG2BQ96BY7 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
ATG2BQ96BY7 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATG2BQ96BY7 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATG2BQ96BY7 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATG2BQ96BY7 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATG2BQ96BY7 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
ATG2BQ96BY7 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATG2BQ96BY7 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATG2BQ96BY7 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATG2BQ96BY7 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATG2BQ96BY7 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATG2BQ96BY7 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATG2BQ96BY7 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATG2BQ96BY7 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATG2BQ96BY7 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATG2BQ96BY7 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATG2BQ96BY7 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATG2BQ96BY7 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATG2BQ96BY7 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATG2BQ96BY7 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATG2BQ96BY7 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATG2BQ96BY7 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATG2BQ96BY7 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATG2BQ96BY7 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATG2BQ96BY7 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATG2BQ96BY7 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATG2BQ96BY7 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATG2BQ96BY7 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATG2BQ96BY7 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATG2BQ96BY7 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATG2BQ96BY7 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
ATG2BQ96BY7 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
ATG2BQ96BY7 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC21.95■■□□□ 1.11
ATG2BQ96BY7 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
ATG2BQ96BY7 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
ATG2BQ96BY7 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATG2BQ96BY7 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATG2BQ96BY7 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATG2BQ96BY7 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATG2BQ96BY7 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATG2BQ96BY7 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms