Protein–RNA interactions for Protein: Q969K3

RNF34, E3 ubiquitin-protein ligase RNF34, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF34Q969K3 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RNF34Q969K3 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RNF34Q969K3 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
RNF34Q969K3 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
RNF34Q969K3 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RNF34Q969K3 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RNF34Q969K3 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RNF34Q969K3 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RNF34Q969K3 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RNF34Q969K3 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RNF34Q969K3 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RNF34Q969K3 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RNF34Q969K3 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RNF34Q969K3 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RNF34Q969K3 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RNF34Q969K3 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RNF34Q969K3 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RNF34Q969K3 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RNF34Q969K3 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RNF34Q969K3 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RNF34Q969K3 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RNF34Q969K3 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RNF34Q969K3 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RNF34Q969K3 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RNF34Q969K3 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RNF34Q969K3 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RNF34Q969K3 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RNF34Q969K3 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RNF34Q969K3 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RNF34Q969K3 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RNF34Q969K3 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RNF34Q969K3 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RNF34Q969K3 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RNF34Q969K3 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RNF34Q969K3 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RNF34Q969K3 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
RNF34Q969K3 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RNF34Q969K3 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RNF34Q969K3 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
RNF34Q969K3 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RNF34Q969K3 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RNF34Q969K3 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RNF34Q969K3 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RNF34Q969K3 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RNF34Q969K3 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RNF34Q969K3 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
RNF34Q969K3 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
RNF34Q969K3 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RNF34Q969K3 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RNF34Q969K3 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RNF34Q969K3 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RNF34Q969K3 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RNF34Q969K3 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RNF34Q969K3 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RNF34Q969K3 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RNF34Q969K3 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RNF34Q969K3 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RNF34Q969K3 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RNF34Q969K3 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RNF34Q969K3 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RNF34Q969K3 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RNF34Q969K3 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RNF34Q969K3 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
RNF34Q969K3 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
RNF34Q969K3 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RNF34Q969K3 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RNF34Q969K3 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RNF34Q969K3 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RNF34Q969K3 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RNF34Q969K3 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RNF34Q969K3 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RNF34Q969K3 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RNF34Q969K3 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RNF34Q969K3 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RNF34Q969K3 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RNF34Q969K3 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RNF34Q969K3 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RNF34Q969K3 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RNF34Q969K3 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
RNF34Q969K3 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
RNF34Q969K3 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RNF34Q969K3 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RNF34Q969K3 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RNF34Q969K3 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RNF34Q969K3 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RNF34Q969K3 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RNF34Q969K3 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RNF34Q969K3 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RNF34Q969K3 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RNF34Q969K3 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RNF34Q969K3 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RNF34Q969K3 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RNF34Q969K3 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RNF34Q969K3 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RNF34Q969K3 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
RNF34Q969K3 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RNF34Q969K3 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RNF34Q969K3 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RNF34Q969K3 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RNF34Q969K3 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms