Protein–RNA interactions for Protein: Q93099

HGD, Homogentisate 1,2-dioxygenase, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HGDQ93099 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HGDQ93099 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC20■□□□□ 0.79
HGDQ93099 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HGDQ93099 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HGDQ93099 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HGDQ93099 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HGDQ93099 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HGDQ93099 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HGDQ93099 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
HGDQ93099 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
HGDQ93099 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HGDQ93099 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HGDQ93099 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
HGDQ93099 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HGDQ93099 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HGDQ93099 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HGDQ93099 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
HGDQ93099 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HGDQ93099 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HGDQ93099 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HGDQ93099 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HGDQ93099 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HGDQ93099 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HGDQ93099 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HGDQ93099 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC19.98■□□□□ 0.79
HGDQ93099 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HGDQ93099 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
HGDQ93099 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HGDQ93099 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
HGDQ93099 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
HGDQ93099 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HGDQ93099 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HGDQ93099 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HGDQ93099 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
HGDQ93099 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
HGDQ93099 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
HGDQ93099 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HGDQ93099 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
HGDQ93099 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
HGDQ93099 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HGDQ93099 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
HGDQ93099 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
HGDQ93099 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HGDQ93099 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HGDQ93099 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HGDQ93099 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
HGDQ93099 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
HGDQ93099 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
HGDQ93099 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
HGDQ93099 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
HGDQ93099 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
HGDQ93099 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
HGDQ93099 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
HGDQ93099 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
HGDQ93099 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
HGDQ93099 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
HGDQ93099 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
HGDQ93099 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
HGDQ93099 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
HGDQ93099 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
HGDQ93099 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
HGDQ93099 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
HGDQ93099 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
HGDQ93099 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
HGDQ93099 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
HGDQ93099 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
HGDQ93099 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
HGDQ93099 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
HGDQ93099 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
HGDQ93099 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
HGDQ93099 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
HGDQ93099 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
HGDQ93099 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
HGDQ93099 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
HGDQ93099 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
HGDQ93099 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
HGDQ93099 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
HGDQ93099 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
HGDQ93099 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
HGDQ93099 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
HGDQ93099 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
HGDQ93099 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
HGDQ93099 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
HGDQ93099 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
HGDQ93099 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
HGDQ93099 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
HGDQ93099 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
HGDQ93099 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC19.94■□□□□ 0.78
HGDQ93099 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
HGDQ93099 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
HGDQ93099 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
HGDQ93099 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
HGDQ93099 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
HGDQ93099 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
HGDQ93099 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
HGDQ93099 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
HGDQ93099 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
HGDQ93099 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
HGDQ93099 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
HGDQ93099 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.7 ms