Protein–RNA interactions for Protein: Q92932

PTPRN2, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase N2, humanhuman

Predictions only

Length 1,015 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRN2Q92932 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTPRN2Q92932 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTPRN2Q92932 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTPRN2Q92932 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTPRN2Q92932 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTPRN2Q92932 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTPRN2Q92932 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTPRN2Q92932 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTPRN2Q92932 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTPRN2Q92932 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTPRN2Q92932 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTPRN2Q92932 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTPRN2Q92932 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTPRN2Q92932 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTPRN2Q92932 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTPRN2Q92932 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTPRN2Q92932 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTPRN2Q92932 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTPRN2Q92932 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTPRN2Q92932 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTPRN2Q92932 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
PTPRN2Q92932 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
PTPRN2Q92932 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
PTPRN2Q92932 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
PTPRN2Q92932 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
PTPRN2Q92932 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTPRN2Q92932 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTPRN2Q92932 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTPRN2Q92932 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTPRN2Q92932 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTPRN2Q92932 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
PTPRN2Q92932 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTPRN2Q92932 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTPRN2Q92932 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTPRN2Q92932 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTPRN2Q92932 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTPRN2Q92932 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTPRN2Q92932 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTPRN2Q92932 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTPRN2Q92932 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTPRN2Q92932 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTPRN2Q92932 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTPRN2Q92932 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
PTPRN2Q92932 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTPRN2Q92932 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTPRN2Q92932 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPRN2Q92932 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPRN2Q92932 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPRN2Q92932 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPRN2Q92932 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPRN2Q92932 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPRN2Q92932 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPRN2Q92932 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPRN2Q92932 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPRN2Q92932 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPRN2Q92932 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPRN2Q92932 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPRN2Q92932 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPRN2Q92932 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPRN2Q92932 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPRN2Q92932 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTPRN2Q92932 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTPRN2Q92932 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTPRN2Q92932 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTPRN2Q92932 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTPRN2Q92932 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTPRN2Q92932 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTPRN2Q92932 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTPRN2Q92932 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTPRN2Q92932 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTPRN2Q92932 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTPRN2Q92932 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTPRN2Q92932 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTPRN2Q92932 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PTPRN2Q92932 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTPRN2Q92932 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTPRN2Q92932 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTPRN2Q92932 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTPRN2Q92932 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTPRN2Q92932 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTPRN2Q92932 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTPRN2Q92932 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTPRN2Q92932 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTPRN2Q92932 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPRN2Q92932 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPRN2Q92932 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPRN2Q92932 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPRN2Q92932 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPRN2Q92932 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPRN2Q92932 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPRN2Q92932 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPRN2Q92932 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPRN2Q92932 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPRN2Q92932 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPRN2Q92932 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPRN2Q92932 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPRN2Q92932 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPRN2Q92932 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPRN2Q92932 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPRN2Q92932 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms