Protein–RNA interactions for Protein: Q92922

SMARCC1, SWI/SNF complex subunit SMARCC1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCC1Q92922 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SMARCC1Q92922 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SMARCC1Q92922 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SMARCC1Q92922 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SMARCC1Q92922 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SMARCC1Q92922 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
SMARCC1Q92922 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.08
SMARCC1Q92922 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SMARCC1Q92922 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SMARCC1Q92922 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SMARCC1Q92922 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SMARCC1Q92922 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SMARCC1Q92922 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SMARCC1Q92922 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SMARCC1Q92922 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SMARCC1Q92922 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SMARCC1Q92922 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SMARCC1Q92922 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SMARCC1Q92922 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SMARCC1Q92922 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC28■■■□□ 2.07
SMARCC1Q92922 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC28■■■□□ 2.07
SMARCC1Q92922 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
SMARCC1Q92922 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
SMARCC1Q92922 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SMARCC1Q92922 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SMARCC1Q92922 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SMARCC1Q92922 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
SMARCC1Q92922 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SMARCC1Q92922 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SMARCC1Q92922 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SMARCC1Q92922 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SMARCC1Q92922 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SMARCC1Q92922 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SMARCC1Q92922 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SMARCC1Q92922 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SMARCC1Q92922 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
SMARCC1Q92922 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SMARCC1Q92922 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SMARCC1Q92922 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SMARCC1Q92922 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SMARCC1Q92922 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
SMARCC1Q92922 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SMARCC1Q92922 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SMARCC1Q92922 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
SMARCC1Q92922 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SMARCC1Q92922 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SMARCC1Q92922 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SMARCC1Q92922 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SMARCC1Q92922 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SMARCC1Q92922 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SMARCC1Q92922 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SMARCC1Q92922 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SMARCC1Q92922 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SMARCC1Q92922 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SMARCC1Q92922 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SMARCC1Q92922 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SMARCC1Q92922 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
SMARCC1Q92922 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SMARCC1Q92922 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
SMARCC1Q92922 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
SMARCC1Q92922 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
SMARCC1Q92922 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
SMARCC1Q92922 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
SMARCC1Q92922 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
SMARCC1Q92922 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SMARCC1Q92922 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SMARCC1Q92922 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SMARCC1Q92922 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SMARCC1Q92922 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SMARCC1Q92922 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SMARCC1Q92922 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SMARCC1Q92922 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SMARCC1Q92922 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SMARCC1Q92922 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SMARCC1Q92922 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SMARCC1Q92922 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SMARCC1Q92922 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SMARCC1Q92922 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SMARCC1Q92922 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SMARCC1Q92922 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SMARCC1Q92922 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SMARCC1Q92922 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
SMARCC1Q92922 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SMARCC1Q92922 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SMARCC1Q92922 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SMARCC1Q92922 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SMARCC1Q92922 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SMARCC1Q92922 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
SMARCC1Q92922 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SMARCC1Q92922 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SMARCC1Q92922 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SMARCC1Q92922 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SMARCC1Q92922 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SMARCC1Q92922 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SMARCC1Q92922 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SMARCC1Q92922 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SMARCC1Q92922 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SMARCC1Q92922 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SMARCC1Q92922 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SMARCC1Q92922 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms