Protein–RNA interactions for Protein: Q92826

HOXB13, Homeobox protein Hox-B13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB13Q92826 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXB13Q92826 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXB13Q92826 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXB13Q92826 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXB13Q92826 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXB13Q92826 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXB13Q92826 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXB13Q92826 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXB13Q92826 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXB13Q92826 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXB13Q92826 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXB13Q92826 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXB13Q92826 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXB13Q92826 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXB13Q92826 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXB13Q92826 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXB13Q92826 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXB13Q92826 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXB13Q92826 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXB13Q92826 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXB13Q92826 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXB13Q92826 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HOXB13Q92826 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HOXB13Q92826 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HOXB13Q92826 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HOXB13Q92826 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HOXB13Q92826 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HOXB13Q92826 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HOXB13Q92826 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HOXB13Q92826 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HOXB13Q92826 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HOXB13Q92826 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HOXB13Q92826 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HOXB13Q92826 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HOXB13Q92826 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HOXB13Q92826 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HOXB13Q92826 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HOXB13Q92826 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HOXB13Q92826 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
HOXB13Q92826 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HOXB13Q92826 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HOXB13Q92826 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HOXB13Q92826 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HOXB13Q92826 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HOXB13Q92826 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HOXB13Q92826 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HOXB13Q92826 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HOXB13Q92826 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HOXB13Q92826 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HOXB13Q92826 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
HOXB13Q92826 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HOXB13Q92826 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HOXB13Q92826 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HOXB13Q92826 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HOXB13Q92826 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HOXB13Q92826 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HOXB13Q92826 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HOXB13Q92826 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HOXB13Q92826 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
HOXB13Q92826 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HOXB13Q92826 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
HOXB13Q92826 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HOXB13Q92826 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HOXB13Q92826 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HOXB13Q92826 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HOXB13Q92826 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HOXB13Q92826 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HOXB13Q92826 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HOXB13Q92826 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HOXB13Q92826 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HOXB13Q92826 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HOXB13Q92826 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HOXB13Q92826 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HOXB13Q92826 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HOXB13Q92826 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HOXB13Q92826 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HOXB13Q92826 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HOXB13Q92826 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HOXB13Q92826 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HOXB13Q92826 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
HOXB13Q92826 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
HOXB13Q92826 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
HOXB13Q92826 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HOXB13Q92826 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HOXB13Q92826 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HOXB13Q92826 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HOXB13Q92826 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HOXB13Q92826 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HOXB13Q92826 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
HOXB13Q92826 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
HOXB13Q92826 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
HOXB13Q92826 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HOXB13Q92826 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
HOXB13Q92826 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
HOXB13Q92826 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HOXB13Q92826 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HOXB13Q92826 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HOXB13Q92826 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HOXB13Q92826 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HOXB13Q92826 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms