Protein–RNA interactions for Protein: Q8WYN3

CSRNP3, Cysteine/serine-rich nuclear protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 585 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSRNP3Q8WYN3 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
CSRNP3Q8WYN3 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC35.64■■■■□ 3.3
CSRNP3Q8WYN3 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
CSRNP3Q8WYN3 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC35.64■■■■□ 3.3
CSRNP3Q8WYN3 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC35.64■■■■□ 3.3
CSRNP3Q8WYN3 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC35.64■■■■□ 3.3
CSRNP3Q8WYN3 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC35.64■■■■□ 3.3
CSRNP3Q8WYN3 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC35.64■■■■□ 3.3
CSRNP3Q8WYN3 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC35.63■■■■□ 3.29
CSRNP3Q8WYN3 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
CSRNP3Q8WYN3 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC35.63■■■■□ 3.29
CSRNP3Q8WYN3 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.63■■■■□ 3.29
CSRNP3Q8WYN3 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
CSRNP3Q8WYN3 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
CSRNP3Q8WYN3 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC35.63■■■■□ 3.29
CSRNP3Q8WYN3 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
CSRNP3Q8WYN3 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
CSRNP3Q8WYN3 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
CSRNP3Q8WYN3 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
CSRNP3Q8WYN3 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
CSRNP3Q8WYN3 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
CSRNP3Q8WYN3 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.61■■■■□ 3.29
CSRNP3Q8WYN3 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC35.61■■■■□ 3.29
CSRNP3Q8WYN3 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC35.61■■■■□ 3.29
CSRNP3Q8WYN3 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC35.61■■■■□ 3.29
CSRNP3Q8WYN3 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC35.61■■■■□ 3.29
CSRNP3Q8WYN3 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC35.6■■■■□ 3.29
CSRNP3Q8WYN3 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
CSRNP3Q8WYN3 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.6■■■■□ 3.29
CSRNP3Q8WYN3 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
CSRNP3Q8WYN3 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
CSRNP3Q8WYN3 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
CSRNP3Q8WYN3 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
CSRNP3Q8WYN3 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
CSRNP3Q8WYN3 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
CSRNP3Q8WYN3 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
CSRNP3Q8WYN3 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
CSRNP3Q8WYN3 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
CSRNP3Q8WYN3 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
CSRNP3Q8WYN3 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
CSRNP3Q8WYN3 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
CSRNP3Q8WYN3 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC35.59■■■■□ 3.29
CSRNP3Q8WYN3 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC35.59■■■■□ 3.29
CSRNP3Q8WYN3 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC35.59■■■■□ 3.29
CSRNP3Q8WYN3 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
CSRNP3Q8WYN3 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC35.59■■■■□ 3.29
CSRNP3Q8WYN3 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
CSRNP3Q8WYN3 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
CSRNP3Q8WYN3 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC35.59■■■■□ 3.29
CSRNP3Q8WYN3 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.58■■■■□ 3.29
CSRNP3Q8WYN3 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
CSRNP3Q8WYN3 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC35.58■■■■□ 3.29
CSRNP3Q8WYN3 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.58■■■■□ 3.29
CSRNP3Q8WYN3 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
CSRNP3Q8WYN3 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.57■■■■□ 3.28
CSRNP3Q8WYN3 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC35.57■■■■□ 3.28
CSRNP3Q8WYN3 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC35.57■■■■□ 3.28
CSRNP3Q8WYN3 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
CSRNP3Q8WYN3 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
CSRNP3Q8WYN3 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
CSRNP3Q8WYN3 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC35.56■■■■□ 3.28
CSRNP3Q8WYN3 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC35.56■■■■□ 3.28
CSRNP3Q8WYN3 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC35.56■■■■□ 3.28
CSRNP3Q8WYN3 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
CSRNP3Q8WYN3 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
CSRNP3Q8WYN3 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC35.55■■■■□ 3.28
CSRNP3Q8WYN3 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
CSRNP3Q8WYN3 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
CSRNP3Q8WYN3 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
CSRNP3Q8WYN3 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
CSRNP3Q8WYN3 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
CSRNP3Q8WYN3 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
CSRNP3Q8WYN3 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC35.55■■■■□ 3.28
CSRNP3Q8WYN3 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC35.55■■■■□ 3.28
CSRNP3Q8WYN3 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
CSRNP3Q8WYN3 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC35.55■■■■□ 3.28
CSRNP3Q8WYN3 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
CSRNP3Q8WYN3 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
CSRNP3Q8WYN3 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
CSRNP3Q8WYN3 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC35.54■■■■□ 3.28
CSRNP3Q8WYN3 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC35.54■■■■□ 3.28
CSRNP3Q8WYN3 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
CSRNP3Q8WYN3 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
CSRNP3Q8WYN3 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
CSRNP3Q8WYN3 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC35.53■■■■□ 3.28
CSRNP3Q8WYN3 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC35.53■■■■□ 3.28
CSRNP3Q8WYN3 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC35.53■■■■□ 3.28
CSRNP3Q8WYN3 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
CSRNP3Q8WYN3 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC35.52■■■■□ 3.28
CSRNP3Q8WYN3 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC35.52■■■■□ 3.28
CSRNP3Q8WYN3 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
CSRNP3Q8WYN3 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
CSRNP3Q8WYN3 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC35.52■■■■□ 3.28
CSRNP3Q8WYN3 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC35.52■■■■□ 3.28
CSRNP3Q8WYN3 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC35.52■■■■□ 3.28
CSRNP3Q8WYN3 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
CSRNP3Q8WYN3 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
CSRNP3Q8WYN3 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC35.51■■■■□ 3.28
CSRNP3Q8WYN3 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC35.51■■■■□ 3.28
CSRNP3Q8WYN3 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms