Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXI8

CLEC4D, C-type lectin domain family 4 member D, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLEC4DQ8WXI8 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CLEC4DQ8WXI8 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CLEC4DQ8WXI8 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CLEC4DQ8WXI8 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CLEC4DQ8WXI8 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CLEC4DQ8WXI8 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
CLEC4DQ8WXI8 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
CLEC4DQ8WXI8 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CLEC4DQ8WXI8 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CLEC4DQ8WXI8 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CLEC4DQ8WXI8 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CLEC4DQ8WXI8 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CLEC4DQ8WXI8 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CLEC4DQ8WXI8 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CLEC4DQ8WXI8 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
CLEC4DQ8WXI8 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CLEC4DQ8WXI8 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
CLEC4DQ8WXI8 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CLEC4DQ8WXI8 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CLEC4DQ8WXI8 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CLEC4DQ8WXI8 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CLEC4DQ8WXI8 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CLEC4DQ8WXI8 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CLEC4DQ8WXI8 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CLEC4DQ8WXI8 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CLEC4DQ8WXI8 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CLEC4DQ8WXI8 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CLEC4DQ8WXI8 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
CLEC4DQ8WXI8 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CLEC4DQ8WXI8 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CLEC4DQ8WXI8 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CLEC4DQ8WXI8 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CLEC4DQ8WXI8 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CLEC4DQ8WXI8 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CLEC4DQ8WXI8 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
CLEC4DQ8WXI8 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
CLEC4DQ8WXI8 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CLEC4DQ8WXI8 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CLEC4DQ8WXI8 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CLEC4DQ8WXI8 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CLEC4DQ8WXI8 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CLEC4DQ8WXI8 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CLEC4DQ8WXI8 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CLEC4DQ8WXI8 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CLEC4DQ8WXI8 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CLEC4DQ8WXI8 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CLEC4DQ8WXI8 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CLEC4DQ8WXI8 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CLEC4DQ8WXI8 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CLEC4DQ8WXI8 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
CLEC4DQ8WXI8 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CLEC4DQ8WXI8 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CLEC4DQ8WXI8 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CLEC4DQ8WXI8 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CLEC4DQ8WXI8 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CLEC4DQ8WXI8 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CLEC4DQ8WXI8 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CLEC4DQ8WXI8 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CLEC4DQ8WXI8 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
CLEC4DQ8WXI8 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CLEC4DQ8WXI8 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CLEC4DQ8WXI8 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CLEC4DQ8WXI8 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CLEC4DQ8WXI8 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CLEC4DQ8WXI8 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CLEC4DQ8WXI8 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CLEC4DQ8WXI8 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CLEC4DQ8WXI8 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CLEC4DQ8WXI8 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CLEC4DQ8WXI8 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CLEC4DQ8WXI8 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CLEC4DQ8WXI8 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CLEC4DQ8WXI8 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CLEC4DQ8WXI8 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CLEC4DQ8WXI8 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CLEC4DQ8WXI8 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CLEC4DQ8WXI8 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CLEC4DQ8WXI8 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CLEC4DQ8WXI8 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CLEC4DQ8WXI8 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CLEC4DQ8WXI8 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CLEC4DQ8WXI8 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CLEC4DQ8WXI8 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CLEC4DQ8WXI8 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CLEC4DQ8WXI8 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CLEC4DQ8WXI8 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CLEC4DQ8WXI8 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CLEC4DQ8WXI8 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CLEC4DQ8WXI8 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CLEC4DQ8WXI8 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CLEC4DQ8WXI8 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CLEC4DQ8WXI8 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CLEC4DQ8WXI8 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CLEC4DQ8WXI8 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CLEC4DQ8WXI8 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CLEC4DQ8WXI8 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
CLEC4DQ8WXI8 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
CLEC4DQ8WXI8 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
CLEC4DQ8WXI8 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CLEC4DQ8WXI8 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
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