Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXF7

ATL1, Atlastin-1, humanhuman

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATL1Q8WXF7 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ATL1Q8WXF7 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ATL1Q8WXF7 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ATL1Q8WXF7 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ATL1Q8WXF7 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ATL1Q8WXF7 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ATL1Q8WXF7 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATL1Q8WXF7 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATL1Q8WXF7 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATL1Q8WXF7 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATL1Q8WXF7 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATL1Q8WXF7 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATL1Q8WXF7 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATL1Q8WXF7 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATL1Q8WXF7 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATL1Q8WXF7 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATL1Q8WXF7 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATL1Q8WXF7 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATL1Q8WXF7 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATL1Q8WXF7 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATL1Q8WXF7 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATL1Q8WXF7 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATL1Q8WXF7 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATL1Q8WXF7 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATL1Q8WXF7 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATL1Q8WXF7 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATL1Q8WXF7 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATL1Q8WXF7 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATL1Q8WXF7 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
ATL1Q8WXF7 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATL1Q8WXF7 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATL1Q8WXF7 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATL1Q8WXF7 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATL1Q8WXF7 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATL1Q8WXF7 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATL1Q8WXF7 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATL1Q8WXF7 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATL1Q8WXF7 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATL1Q8WXF7 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATL1Q8WXF7 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATL1Q8WXF7 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATL1Q8WXF7 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATL1Q8WXF7 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATL1Q8WXF7 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATL1Q8WXF7 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATL1Q8WXF7 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATL1Q8WXF7 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATL1Q8WXF7 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATL1Q8WXF7 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATL1Q8WXF7 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATL1Q8WXF7 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATL1Q8WXF7 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
ATL1Q8WXF7 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATL1Q8WXF7 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
ATL1Q8WXF7 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
ATL1Q8WXF7 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATL1Q8WXF7 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATL1Q8WXF7 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATL1Q8WXF7 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATL1Q8WXF7 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATL1Q8WXF7 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATL1Q8WXF7 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATL1Q8WXF7 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
ATL1Q8WXF7 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATL1Q8WXF7 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATL1Q8WXF7 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATL1Q8WXF7 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATL1Q8WXF7 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATL1Q8WXF7 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATL1Q8WXF7 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATL1Q8WXF7 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATL1Q8WXF7 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATL1Q8WXF7 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATL1Q8WXF7 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATL1Q8WXF7 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATL1Q8WXF7 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATL1Q8WXF7 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ATL1Q8WXF7 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ATL1Q8WXF7 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ATL1Q8WXF7 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ATL1Q8WXF7 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ATL1Q8WXF7 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ATL1Q8WXF7 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ATL1Q8WXF7 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ATL1Q8WXF7 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ATL1Q8WXF7 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
ATL1Q8WXF7 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ATL1Q8WXF7 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ATL1Q8WXF7 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ATL1Q8WXF7 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
ATL1Q8WXF7 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
ATL1Q8WXF7 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
ATL1Q8WXF7 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
ATL1Q8WXF7 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
ATL1Q8WXF7 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATL1Q8WXF7 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATL1Q8WXF7 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATL1Q8WXF7 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATL1Q8WXF7 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATL1Q8WXF7 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.8 ms