Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWY3

PRPF31, U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp31, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 499 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF31Q8WWY3 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PRPF31Q8WWY3 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PRPF31Q8WWY3 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PRPF31Q8WWY3 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PRPF31Q8WWY3 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PRPF31Q8WWY3 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PRPF31Q8WWY3 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PRPF31Q8WWY3 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PRPF31Q8WWY3 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PRPF31Q8WWY3 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PRPF31Q8WWY3 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PRPF31Q8WWY3 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PRPF31Q8WWY3 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PRPF31Q8WWY3 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
PRPF31Q8WWY3 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PRPF31Q8WWY3 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PRPF31Q8WWY3 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PRPF31Q8WWY3 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PRPF31Q8WWY3 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PRPF31Q8WWY3 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PRPF31Q8WWY3 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PRPF31Q8WWY3 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PRPF31Q8WWY3 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PRPF31Q8WWY3 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PRPF31Q8WWY3 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PRPF31Q8WWY3 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PRPF31Q8WWY3 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PRPF31Q8WWY3 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PRPF31Q8WWY3 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PRPF31Q8WWY3 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PRPF31Q8WWY3 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PRPF31Q8WWY3 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PRPF31Q8WWY3 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PRPF31Q8WWY3 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PRPF31Q8WWY3 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PRPF31Q8WWY3 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PRPF31Q8WWY3 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PRPF31Q8WWY3 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PRPF31Q8WWY3 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PRPF31Q8WWY3 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PRPF31Q8WWY3 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PRPF31Q8WWY3 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
PRPF31Q8WWY3 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PRPF31Q8WWY3 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PRPF31Q8WWY3 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PRPF31Q8WWY3 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PRPF31Q8WWY3 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PRPF31Q8WWY3 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PRPF31Q8WWY3 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PRPF31Q8WWY3 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PRPF31Q8WWY3 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PRPF31Q8WWY3 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PRPF31Q8WWY3 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PRPF31Q8WWY3 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PRPF31Q8WWY3 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PRPF31Q8WWY3 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PRPF31Q8WWY3 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PRPF31Q8WWY3 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PRPF31Q8WWY3 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
PRPF31Q8WWY3 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PRPF31Q8WWY3 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PRPF31Q8WWY3 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PRPF31Q8WWY3 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PRPF31Q8WWY3 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PRPF31Q8WWY3 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PRPF31Q8WWY3 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PRPF31Q8WWY3 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PRPF31Q8WWY3 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PRPF31Q8WWY3 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PRPF31Q8WWY3 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PRPF31Q8WWY3 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
PRPF31Q8WWY3 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PRPF31Q8WWY3 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PRPF31Q8WWY3 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PRPF31Q8WWY3 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
PRPF31Q8WWY3 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PRPF31Q8WWY3 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PRPF31Q8WWY3 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PRPF31Q8WWY3 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PRPF31Q8WWY3 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PRPF31Q8WWY3 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PRPF31Q8WWY3 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PRPF31Q8WWY3 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PRPF31Q8WWY3 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PRPF31Q8WWY3 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PRPF31Q8WWY3 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PRPF31Q8WWY3 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PRPF31Q8WWY3 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PRPF31Q8WWY3 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PRPF31Q8WWY3 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PRPF31Q8WWY3 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PRPF31Q8WWY3 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PRPF31Q8WWY3 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PRPF31Q8WWY3 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PRPF31Q8WWY3 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PRPF31Q8WWY3 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PRPF31Q8WWY3 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PRPF31Q8WWY3 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PRPF31Q8WWY3 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PRPF31Q8WWY3 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms