Protein–RNA interactions for Protein: Q8WVT3

TRAPPC12, Trafficking protein particle complex subunit 12, humanhuman

Predictions only

Length 735 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC12Q8WVT3 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRAPPC12Q8WVT3 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
TRAPPC12Q8WVT3 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
TRAPPC12Q8WVT3 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRAPPC12Q8WVT3 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRAPPC12Q8WVT3 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRAPPC12Q8WVT3 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRAPPC12Q8WVT3 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRAPPC12Q8WVT3 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRAPPC12Q8WVT3 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRAPPC12Q8WVT3 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRAPPC12Q8WVT3 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRAPPC12Q8WVT3 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
TRAPPC12Q8WVT3 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRAPPC12Q8WVT3 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRAPPC12Q8WVT3 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRAPPC12Q8WVT3 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRAPPC12Q8WVT3 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRAPPC12Q8WVT3 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRAPPC12Q8WVT3 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRAPPC12Q8WVT3 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
TRAPPC12Q8WVT3 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRAPPC12Q8WVT3 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRAPPC12Q8WVT3 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
TRAPPC12Q8WVT3 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRAPPC12Q8WVT3 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRAPPC12Q8WVT3 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
TRAPPC12Q8WVT3 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRAPPC12Q8WVT3 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRAPPC12Q8WVT3 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
TRAPPC12Q8WVT3 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRAPPC12Q8WVT3 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRAPPC12Q8WVT3 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRAPPC12Q8WVT3 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRAPPC12Q8WVT3 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRAPPC12Q8WVT3 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRAPPC12Q8WVT3 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
TRAPPC12Q8WVT3 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRAPPC12Q8WVT3 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRAPPC12Q8WVT3 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRAPPC12Q8WVT3 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRAPPC12Q8WVT3 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRAPPC12Q8WVT3 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRAPPC12Q8WVT3 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRAPPC12Q8WVT3 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRAPPC12Q8WVT3 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRAPPC12Q8WVT3 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRAPPC12Q8WVT3 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRAPPC12Q8WVT3 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRAPPC12Q8WVT3 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRAPPC12Q8WVT3 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRAPPC12Q8WVT3 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRAPPC12Q8WVT3 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRAPPC12Q8WVT3 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRAPPC12Q8WVT3 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRAPPC12Q8WVT3 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRAPPC12Q8WVT3 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TRAPPC12Q8WVT3 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TRAPPC12Q8WVT3 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TRAPPC12Q8WVT3 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TRAPPC12Q8WVT3 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
TRAPPC12Q8WVT3 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TRAPPC12Q8WVT3 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TRAPPC12Q8WVT3 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC24■■□□□ 1.43
TRAPPC12Q8WVT3 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
TRAPPC12Q8WVT3 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRAPPC12Q8WVT3 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRAPPC12Q8WVT3 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRAPPC12Q8WVT3 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRAPPC12Q8WVT3 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRAPPC12Q8WVT3 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRAPPC12Q8WVT3 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRAPPC12Q8WVT3 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRAPPC12Q8WVT3 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRAPPC12Q8WVT3 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRAPPC12Q8WVT3 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRAPPC12Q8WVT3 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRAPPC12Q8WVT3 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRAPPC12Q8WVT3 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRAPPC12Q8WVT3 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRAPPC12Q8WVT3 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRAPPC12Q8WVT3 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRAPPC12Q8WVT3 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRAPPC12Q8WVT3 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRAPPC12Q8WVT3 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRAPPC12Q8WVT3 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRAPPC12Q8WVT3 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRAPPC12Q8WVT3 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRAPPC12Q8WVT3 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRAPPC12Q8WVT3 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRAPPC12Q8WVT3 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRAPPC12Q8WVT3 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRAPPC12Q8WVT3 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRAPPC12Q8WVT3 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRAPPC12Q8WVT3 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRAPPC12Q8WVT3 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRAPPC12Q8WVT3 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRAPPC12Q8WVT3 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRAPPC12Q8WVT3 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRAPPC12Q8WVT3 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms