Protein–RNA interactions for Protein: Q8TAP4

LMO3, LIM domain only protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3Q8TAP4 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
LMO3Q8TAP4 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LMO3Q8TAP4 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
LMO3Q8TAP4 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
LMO3Q8TAP4 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
LMO3Q8TAP4 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
LMO3Q8TAP4 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LMO3Q8TAP4 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
LMO3Q8TAP4 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LMO3Q8TAP4 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LMO3Q8TAP4 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
LMO3Q8TAP4 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LMO3Q8TAP4 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LMO3Q8TAP4 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LMO3Q8TAP4 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LMO3Q8TAP4 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LMO3Q8TAP4 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LMO3Q8TAP4 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LMO3Q8TAP4 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LMO3Q8TAP4 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LMO3Q8TAP4 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LMO3Q8TAP4 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LMO3Q8TAP4 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LMO3Q8TAP4 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
LMO3Q8TAP4 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LMO3Q8TAP4 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LMO3Q8TAP4 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
LMO3Q8TAP4 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LMO3Q8TAP4 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LMO3Q8TAP4 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LMO3Q8TAP4 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LMO3Q8TAP4 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LMO3Q8TAP4 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LMO3Q8TAP4 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LMO3Q8TAP4 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
LMO3Q8TAP4 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LMO3Q8TAP4 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LMO3Q8TAP4 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LMO3Q8TAP4 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LMO3Q8TAP4 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LMO3Q8TAP4 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LMO3Q8TAP4 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LMO3Q8TAP4 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LMO3Q8TAP4 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
LMO3Q8TAP4 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LMO3Q8TAP4 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LMO3Q8TAP4 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LMO3Q8TAP4 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LMO3Q8TAP4 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LMO3Q8TAP4 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LMO3Q8TAP4 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LMO3Q8TAP4 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LMO3Q8TAP4 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LMO3Q8TAP4 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LMO3Q8TAP4 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LMO3Q8TAP4 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LMO3Q8TAP4 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LMO3Q8TAP4 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
LMO3Q8TAP4 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LMO3Q8TAP4 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LMO3Q8TAP4 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LMO3Q8TAP4 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LMO3Q8TAP4 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LMO3Q8TAP4 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LMO3Q8TAP4 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LMO3Q8TAP4 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LMO3Q8TAP4 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LMO3Q8TAP4 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LMO3Q8TAP4 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LMO3Q8TAP4 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LMO3Q8TAP4 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LMO3Q8TAP4 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
LMO3Q8TAP4 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
LMO3Q8TAP4 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.32
LMO3Q8TAP4 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
LMO3Q8TAP4 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
LMO3Q8TAP4 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
LMO3Q8TAP4 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.32
LMO3Q8TAP4 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LMO3Q8TAP4 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LMO3Q8TAP4 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LMO3Q8TAP4 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LMO3Q8TAP4 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LMO3Q8TAP4 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LMO3Q8TAP4 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LMO3Q8TAP4 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LMO3Q8TAP4 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LMO3Q8TAP4 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LMO3Q8TAP4 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
LMO3Q8TAP4 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LMO3Q8TAP4 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LMO3Q8TAP4 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LMO3Q8TAP4 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
LMO3Q8TAP4 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LMO3Q8TAP4 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LMO3Q8TAP4 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LMO3Q8TAP4 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LMO3Q8TAP4 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LMO3Q8TAP4 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LMO3Q8TAP4 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms