Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEU8

APPL2, DCC-interacting protein 13-beta, humanhuman

Predictions only

Length 664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APPL2Q8NEU8 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
APPL2Q8NEU8 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
APPL2Q8NEU8 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
APPL2Q8NEU8 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
APPL2Q8NEU8 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
APPL2Q8NEU8 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
APPL2Q8NEU8 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
APPL2Q8NEU8 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
APPL2Q8NEU8 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
APPL2Q8NEU8 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
APPL2Q8NEU8 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
APPL2Q8NEU8 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
APPL2Q8NEU8 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
APPL2Q8NEU8 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
APPL2Q8NEU8 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
APPL2Q8NEU8 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
APPL2Q8NEU8 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
APPL2Q8NEU8 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
APPL2Q8NEU8 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
APPL2Q8NEU8 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
APPL2Q8NEU8 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
APPL2Q8NEU8 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
APPL2Q8NEU8 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
APPL2Q8NEU8 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
APPL2Q8NEU8 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
APPL2Q8NEU8 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
APPL2Q8NEU8 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
APPL2Q8NEU8 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
APPL2Q8NEU8 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
APPL2Q8NEU8 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
APPL2Q8NEU8 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
APPL2Q8NEU8 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
APPL2Q8NEU8 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
APPL2Q8NEU8 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
APPL2Q8NEU8 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
APPL2Q8NEU8 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
APPL2Q8NEU8 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
APPL2Q8NEU8 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
APPL2Q8NEU8 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
APPL2Q8NEU8 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
APPL2Q8NEU8 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
APPL2Q8NEU8 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
APPL2Q8NEU8 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
APPL2Q8NEU8 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
APPL2Q8NEU8 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
APPL2Q8NEU8 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
APPL2Q8NEU8 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
APPL2Q8NEU8 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
APPL2Q8NEU8 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
APPL2Q8NEU8 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
APPL2Q8NEU8 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
APPL2Q8NEU8 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
APPL2Q8NEU8 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
APPL2Q8NEU8 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
APPL2Q8NEU8 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
APPL2Q8NEU8 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
APPL2Q8NEU8 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
APPL2Q8NEU8 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
APPL2Q8NEU8 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
APPL2Q8NEU8 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
APPL2Q8NEU8 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
APPL2Q8NEU8 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
APPL2Q8NEU8 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
APPL2Q8NEU8 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
APPL2Q8NEU8 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
APPL2Q8NEU8 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
APPL2Q8NEU8 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
APPL2Q8NEU8 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
APPL2Q8NEU8 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
APPL2Q8NEU8 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
APPL2Q8NEU8 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
APPL2Q8NEU8 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
APPL2Q8NEU8 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
APPL2Q8NEU8 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
APPL2Q8NEU8 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
APPL2Q8NEU8 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
APPL2Q8NEU8 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
APPL2Q8NEU8 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
APPL2Q8NEU8 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
APPL2Q8NEU8 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
APPL2Q8NEU8 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
APPL2Q8NEU8 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
APPL2Q8NEU8 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
APPL2Q8NEU8 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
APPL2Q8NEU8 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
APPL2Q8NEU8 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
APPL2Q8NEU8 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
APPL2Q8NEU8 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
APPL2Q8NEU8 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
APPL2Q8NEU8 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
APPL2Q8NEU8 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
APPL2Q8NEU8 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
APPL2Q8NEU8 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
APPL2Q8NEU8 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
APPL2Q8NEU8 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
APPL2Q8NEU8 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
APPL2Q8NEU8 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
APPL2Q8NEU8 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
APPL2Q8NEU8 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
APPL2Q8NEU8 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms