Protein–RNA interactions for Protein: Q8ND25

ZNRF1, E3 ubiquitin-protein ligase ZNRF1, humanhuman

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNRF1Q8ND25 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ZNRF1Q8ND25 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ZNRF1Q8ND25 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ZNRF1Q8ND25 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ZNRF1Q8ND25 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ZNRF1Q8ND25 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ZNRF1Q8ND25 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZNRF1Q8ND25 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZNRF1Q8ND25 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZNRF1Q8ND25 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZNRF1Q8ND25 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZNRF1Q8ND25 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZNRF1Q8ND25 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZNRF1Q8ND25 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZNRF1Q8ND25 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZNRF1Q8ND25 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZNRF1Q8ND25 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
ZNRF1Q8ND25 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZNRF1Q8ND25 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZNRF1Q8ND25 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
ZNRF1Q8ND25 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZNRF1Q8ND25 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZNRF1Q8ND25 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZNRF1Q8ND25 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZNRF1Q8ND25 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ZNRF1Q8ND25 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ZNRF1Q8ND25 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ZNRF1Q8ND25 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ZNRF1Q8ND25 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ZNRF1Q8ND25 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ZNRF1Q8ND25 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ZNRF1Q8ND25 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ZNRF1Q8ND25 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ZNRF1Q8ND25 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ZNRF1Q8ND25 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ZNRF1Q8ND25 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
ZNRF1Q8ND25 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ZNRF1Q8ND25 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
ZNRF1Q8ND25 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ZNRF1Q8ND25 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ZNRF1Q8ND25 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ZNRF1Q8ND25 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ZNRF1Q8ND25 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ZNRF1Q8ND25 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
ZNRF1Q8ND25 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ZNRF1Q8ND25 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ZNRF1Q8ND25 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ZNRF1Q8ND25 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ZNRF1Q8ND25 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ZNRF1Q8ND25 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ZNRF1Q8ND25 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ZNRF1Q8ND25 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ZNRF1Q8ND25 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ZNRF1Q8ND25 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ZNRF1Q8ND25 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ZNRF1Q8ND25 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ZNRF1Q8ND25 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ZNRF1Q8ND25 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ZNRF1Q8ND25 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ZNRF1Q8ND25 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ZNRF1Q8ND25 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ZNRF1Q8ND25 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ZNRF1Q8ND25 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZNRF1Q8ND25 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZNRF1Q8ND25 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZNRF1Q8ND25 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
ZNRF1Q8ND25 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZNRF1Q8ND25 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZNRF1Q8ND25 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZNRF1Q8ND25 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
ZNRF1Q8ND25 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZNRF1Q8ND25 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZNRF1Q8ND25 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZNRF1Q8ND25 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZNRF1Q8ND25 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZNRF1Q8ND25 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZNRF1Q8ND25 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZNRF1Q8ND25 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZNRF1Q8ND25 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZNRF1Q8ND25 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
ZNRF1Q8ND25 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZNRF1Q8ND25 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZNRF1Q8ND25 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ZNRF1Q8ND25 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ZNRF1Q8ND25 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ZNRF1Q8ND25 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ZNRF1Q8ND25 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZNRF1Q8ND25 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZNRF1Q8ND25 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZNRF1Q8ND25 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZNRF1Q8ND25 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZNRF1Q8ND25 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZNRF1Q8ND25 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZNRF1Q8ND25 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZNRF1Q8ND25 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZNRF1Q8ND25 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZNRF1Q8ND25 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZNRF1Q8ND25 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZNRF1Q8ND25 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNRF1Q8ND25 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms