Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCT1

ARRDC4, Arrestin domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARRDC4Q8NCT1 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ARRDC4Q8NCT1 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ARRDC4Q8NCT1 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ARRDC4Q8NCT1 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
ARRDC4Q8NCT1 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ARRDC4Q8NCT1 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
ARRDC4Q8NCT1 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ARRDC4Q8NCT1 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ARRDC4Q8NCT1 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ARRDC4Q8NCT1 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ARRDC4Q8NCT1 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ARRDC4Q8NCT1 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ARRDC4Q8NCT1 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ARRDC4Q8NCT1 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ARRDC4Q8NCT1 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
ARRDC4Q8NCT1 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ARRDC4Q8NCT1 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ARRDC4Q8NCT1 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ARRDC4Q8NCT1 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ARRDC4Q8NCT1 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ARRDC4Q8NCT1 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ARRDC4Q8NCT1 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ARRDC4Q8NCT1 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ARRDC4Q8NCT1 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ARRDC4Q8NCT1 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ARRDC4Q8NCT1 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ARRDC4Q8NCT1 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ARRDC4Q8NCT1 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ARRDC4Q8NCT1 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ARRDC4Q8NCT1 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ARRDC4Q8NCT1 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ARRDC4Q8NCT1 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ARRDC4Q8NCT1 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ARRDC4Q8NCT1 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ARRDC4Q8NCT1 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ARRDC4Q8NCT1 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ARRDC4Q8NCT1 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ARRDC4Q8NCT1 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ARRDC4Q8NCT1 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ARRDC4Q8NCT1 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
ARRDC4Q8NCT1 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ARRDC4Q8NCT1 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ARRDC4Q8NCT1 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ARRDC4Q8NCT1 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ARRDC4Q8NCT1 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ARRDC4Q8NCT1 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ARRDC4Q8NCT1 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
ARRDC4Q8NCT1 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ARRDC4Q8NCT1 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ARRDC4Q8NCT1 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ARRDC4Q8NCT1 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ARRDC4Q8NCT1 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ARRDC4Q8NCT1 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ARRDC4Q8NCT1 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ARRDC4Q8NCT1 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ARRDC4Q8NCT1 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ARRDC4Q8NCT1 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ARRDC4Q8NCT1 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ARRDC4Q8NCT1 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
ARRDC4Q8NCT1 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ARRDC4Q8NCT1 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ARRDC4Q8NCT1 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ARRDC4Q8NCT1 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ARRDC4Q8NCT1 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ARRDC4Q8NCT1 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ARRDC4Q8NCT1 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ARRDC4Q8NCT1 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ARRDC4Q8NCT1 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ARRDC4Q8NCT1 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ARRDC4Q8NCT1 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ARRDC4Q8NCT1 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ARRDC4Q8NCT1 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ARRDC4Q8NCT1 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ARRDC4Q8NCT1 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ARRDC4Q8NCT1 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ARRDC4Q8NCT1 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ARRDC4Q8NCT1 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ARRDC4Q8NCT1 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ARRDC4Q8NCT1 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ARRDC4Q8NCT1 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
ARRDC4Q8NCT1 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ARRDC4Q8NCT1 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ARRDC4Q8NCT1 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ARRDC4Q8NCT1 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ARRDC4Q8NCT1 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ARRDC4Q8NCT1 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ARRDC4Q8NCT1 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ARRDC4Q8NCT1 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ARRDC4Q8NCT1 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ARRDC4Q8NCT1 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ARRDC4Q8NCT1 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ARRDC4Q8NCT1 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ARRDC4Q8NCT1 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ARRDC4Q8NCT1 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ARRDC4Q8NCT1 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ARRDC4Q8NCT1 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ARRDC4Q8NCT1 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ARRDC4Q8NCT1 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ARRDC4Q8NCT1 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ARRDC4Q8NCT1 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
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