Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCQ7

PROCA1, Protein PROCA1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PROCA1Q8NCQ7 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PROCA1Q8NCQ7 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PROCA1Q8NCQ7 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PROCA1Q8NCQ7 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PROCA1Q8NCQ7 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PROCA1Q8NCQ7 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PROCA1Q8NCQ7 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PROCA1Q8NCQ7 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PROCA1Q8NCQ7 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PROCA1Q8NCQ7 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PROCA1Q8NCQ7 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PROCA1Q8NCQ7 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PROCA1Q8NCQ7 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PROCA1Q8NCQ7 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PROCA1Q8NCQ7 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PROCA1Q8NCQ7 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PROCA1Q8NCQ7 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PROCA1Q8NCQ7 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PROCA1Q8NCQ7 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PROCA1Q8NCQ7 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PROCA1Q8NCQ7 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PROCA1Q8NCQ7 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
PROCA1Q8NCQ7 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PROCA1Q8NCQ7 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PROCA1Q8NCQ7 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PROCA1Q8NCQ7 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PROCA1Q8NCQ7 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PROCA1Q8NCQ7 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PROCA1Q8NCQ7 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
PROCA1Q8NCQ7 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PROCA1Q8NCQ7 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PROCA1Q8NCQ7 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PROCA1Q8NCQ7 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PROCA1Q8NCQ7 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PROCA1Q8NCQ7 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PROCA1Q8NCQ7 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PROCA1Q8NCQ7 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PROCA1Q8NCQ7 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PROCA1Q8NCQ7 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PROCA1Q8NCQ7 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PROCA1Q8NCQ7 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PROCA1Q8NCQ7 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PROCA1Q8NCQ7 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PROCA1Q8NCQ7 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PROCA1Q8NCQ7 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
PROCA1Q8NCQ7 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
PROCA1Q8NCQ7 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PROCA1Q8NCQ7 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PROCA1Q8NCQ7 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PROCA1Q8NCQ7 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PROCA1Q8NCQ7 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PROCA1Q8NCQ7 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PROCA1Q8NCQ7 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PROCA1Q8NCQ7 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PROCA1Q8NCQ7 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PROCA1Q8NCQ7 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PROCA1Q8NCQ7 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PROCA1Q8NCQ7 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PROCA1Q8NCQ7 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PROCA1Q8NCQ7 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PROCA1Q8NCQ7 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PROCA1Q8NCQ7 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
PROCA1Q8NCQ7 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PROCA1Q8NCQ7 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PROCA1Q8NCQ7 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PROCA1Q8NCQ7 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PROCA1Q8NCQ7 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PROCA1Q8NCQ7 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PROCA1Q8NCQ7 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PROCA1Q8NCQ7 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PROCA1Q8NCQ7 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PROCA1Q8NCQ7 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PROCA1Q8NCQ7 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PROCA1Q8NCQ7 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PROCA1Q8NCQ7 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PROCA1Q8NCQ7 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PROCA1Q8NCQ7 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PROCA1Q8NCQ7 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PROCA1Q8NCQ7 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PROCA1Q8NCQ7 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PROCA1Q8NCQ7 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PROCA1Q8NCQ7 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PROCA1Q8NCQ7 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
PROCA1Q8NCQ7 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PROCA1Q8NCQ7 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PROCA1Q8NCQ7 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PROCA1Q8NCQ7 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PROCA1Q8NCQ7 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PROCA1Q8NCQ7 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PROCA1Q8NCQ7 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
PROCA1Q8NCQ7 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PROCA1Q8NCQ7 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PROCA1Q8NCQ7 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
PROCA1Q8NCQ7 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
PROCA1Q8NCQ7 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PROCA1Q8NCQ7 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PROCA1Q8NCQ7 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PROCA1Q8NCQ7 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PROCA1Q8NCQ7 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
PROCA1Q8NCQ7 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms