Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBD8

TMEM229B, Transmembrane protein 229B, humanhuman

Predictions only

Length 167 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM229BQ8NBD8 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TMEM229BQ8NBD8 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TMEM229BQ8NBD8 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TMEM229BQ8NBD8 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TMEM229BQ8NBD8 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TMEM229BQ8NBD8 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TMEM229BQ8NBD8 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TMEM229BQ8NBD8 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TMEM229BQ8NBD8 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TMEM229BQ8NBD8 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TMEM229BQ8NBD8 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TMEM229BQ8NBD8 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TMEM229BQ8NBD8 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TMEM229BQ8NBD8 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TMEM229BQ8NBD8 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TMEM229BQ8NBD8 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TMEM229BQ8NBD8 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TMEM229BQ8NBD8 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
TMEM229BQ8NBD8 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TMEM229BQ8NBD8 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TMEM229BQ8NBD8 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TMEM229BQ8NBD8 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TMEM229BQ8NBD8 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TMEM229BQ8NBD8 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TMEM229BQ8NBD8 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TMEM229BQ8NBD8 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TMEM229BQ8NBD8 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TMEM229BQ8NBD8 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
TMEM229BQ8NBD8 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TMEM229BQ8NBD8 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TMEM229BQ8NBD8 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TMEM229BQ8NBD8 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TMEM229BQ8NBD8 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TMEM229BQ8NBD8 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TMEM229BQ8NBD8 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TMEM229BQ8NBD8 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TMEM229BQ8NBD8 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TMEM229BQ8NBD8 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TMEM229BQ8NBD8 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TMEM229BQ8NBD8 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TMEM229BQ8NBD8 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TMEM229BQ8NBD8 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TMEM229BQ8NBD8 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TMEM229BQ8NBD8 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TMEM229BQ8NBD8 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
TMEM229BQ8NBD8 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TMEM229BQ8NBD8 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TMEM229BQ8NBD8 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TMEM229BQ8NBD8 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TMEM229BQ8NBD8 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TMEM229BQ8NBD8 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TMEM229BQ8NBD8 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TMEM229BQ8NBD8 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TMEM229BQ8NBD8 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TMEM229BQ8NBD8 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TMEM229BQ8NBD8 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TMEM229BQ8NBD8 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TMEM229BQ8NBD8 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TMEM229BQ8NBD8 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TMEM229BQ8NBD8 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TMEM229BQ8NBD8 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TMEM229BQ8NBD8 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TMEM229BQ8NBD8 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TMEM229BQ8NBD8 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TMEM229BQ8NBD8 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TMEM229BQ8NBD8 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TMEM229BQ8NBD8 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TMEM229BQ8NBD8 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TMEM229BQ8NBD8 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TMEM229BQ8NBD8 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TMEM229BQ8NBD8 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TMEM229BQ8NBD8 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TMEM229BQ8NBD8 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TMEM229BQ8NBD8 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TMEM229BQ8NBD8 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TMEM229BQ8NBD8 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TMEM229BQ8NBD8 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TMEM229BQ8NBD8 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TMEM229BQ8NBD8 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TMEM229BQ8NBD8 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TMEM229BQ8NBD8 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
TMEM229BQ8NBD8 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TMEM229BQ8NBD8 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TMEM229BQ8NBD8 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TMEM229BQ8NBD8 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TMEM229BQ8NBD8 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
TMEM229BQ8NBD8 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
TMEM229BQ8NBD8 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.51
TMEM229BQ8NBD8 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
TMEM229BQ8NBD8 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
TMEM229BQ8NBD8 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMEM229BQ8NBD8 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMEM229BQ8NBD8 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMEM229BQ8NBD8 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMEM229BQ8NBD8 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMEM229BQ8NBD8 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMEM229BQ8NBD8 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMEM229BQ8NBD8 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMEM229BQ8NBD8 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMEM229BQ8NBD8 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.1 ms