Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9W5

DNAAF3, Dynein assembly factor 3, axonemal, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAAF3Q8N9W5 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DNAAF3Q8N9W5 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
DNAAF3Q8N9W5 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DNAAF3Q8N9W5 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DNAAF3Q8N9W5 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DNAAF3Q8N9W5 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DNAAF3Q8N9W5 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DNAAF3Q8N9W5 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DNAAF3Q8N9W5 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DNAAF3Q8N9W5 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DNAAF3Q8N9W5 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DNAAF3Q8N9W5 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DNAAF3Q8N9W5 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DNAAF3Q8N9W5 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DNAAF3Q8N9W5 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DNAAF3Q8N9W5 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DNAAF3Q8N9W5 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
DNAAF3Q8N9W5 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DNAAF3Q8N9W5 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DNAAF3Q8N9W5 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DNAAF3Q8N9W5 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DNAAF3Q8N9W5 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DNAAF3Q8N9W5 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DNAAF3Q8N9W5 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DNAAF3Q8N9W5 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
DNAAF3Q8N9W5 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DNAAF3Q8N9W5 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
DNAAF3Q8N9W5 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
DNAAF3Q8N9W5 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
DNAAF3Q8N9W5 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
DNAAF3Q8N9W5 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DNAAF3Q8N9W5 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
DNAAF3Q8N9W5 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DNAAF3Q8N9W5 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
DNAAF3Q8N9W5 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
DNAAF3Q8N9W5 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
DNAAF3Q8N9W5 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
DNAAF3Q8N9W5 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
DNAAF3Q8N9W5 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
DNAAF3Q8N9W5 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
DNAAF3Q8N9W5 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
DNAAF3Q8N9W5 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
DNAAF3Q8N9W5 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
DNAAF3Q8N9W5 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
DNAAF3Q8N9W5 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
DNAAF3Q8N9W5 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
DNAAF3Q8N9W5 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
DNAAF3Q8N9W5 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DNAAF3Q8N9W5 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DNAAF3Q8N9W5 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DNAAF3Q8N9W5 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DNAAF3Q8N9W5 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DNAAF3Q8N9W5 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
DNAAF3Q8N9W5 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DNAAF3Q8N9W5 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
DNAAF3Q8N9W5 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
DNAAF3Q8N9W5 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
DNAAF3Q8N9W5 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
DNAAF3Q8N9W5 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DNAAF3Q8N9W5 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DNAAF3Q8N9W5 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
DNAAF3Q8N9W5 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
DNAAF3Q8N9W5 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DNAAF3Q8N9W5 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
DNAAF3Q8N9W5 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
DNAAF3Q8N9W5 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DNAAF3Q8N9W5 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DNAAF3Q8N9W5 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DNAAF3Q8N9W5 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DNAAF3Q8N9W5 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
DNAAF3Q8N9W5 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22■■□□□ 1.11
DNAAF3Q8N9W5 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22■■□□□ 1.11
DNAAF3Q8N9W5 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DNAAF3Q8N9W5 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DNAAF3Q8N9W5 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DNAAF3Q8N9W5 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
DNAAF3Q8N9W5 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
DNAAF3Q8N9W5 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DNAAF3Q8N9W5 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DNAAF3Q8N9W5 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
DNAAF3Q8N9W5 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
DNAAF3Q8N9W5 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DNAAF3Q8N9W5 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DNAAF3Q8N9W5 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
DNAAF3Q8N9W5 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DNAAF3Q8N9W5 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
DNAAF3Q8N9W5 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
DNAAF3Q8N9W5 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DNAAF3Q8N9W5 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
DNAAF3Q8N9W5 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
DNAAF3Q8N9W5 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
DNAAF3Q8N9W5 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DNAAF3Q8N9W5 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DNAAF3Q8N9W5 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
DNAAF3Q8N9W5 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
DNAAF3Q8N9W5 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
DNAAF3Q8N9W5 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DNAAF3Q8N9W5 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DNAAF3Q8N9W5 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DNAAF3Q8N9W5 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms