Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9V2

TRIML1, Probable E3 ubiquitin-protein ligase TRIML1, humanhuman

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIML1Q8N9V2 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRIML1Q8N9V2 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRIML1Q8N9V2 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRIML1Q8N9V2 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRIML1Q8N9V2 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRIML1Q8N9V2 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRIML1Q8N9V2 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRIML1Q8N9V2 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRIML1Q8N9V2 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRIML1Q8N9V2 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRIML1Q8N9V2 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRIML1Q8N9V2 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRIML1Q8N9V2 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRIML1Q8N9V2 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TRIML1Q8N9V2 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
TRIML1Q8N9V2 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
TRIML1Q8N9V2 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TRIML1Q8N9V2 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRIML1Q8N9V2 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRIML1Q8N9V2 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRIML1Q8N9V2 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
TRIML1Q8N9V2 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
TRIML1Q8N9V2 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
TRIML1Q8N9V2 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
TRIML1Q8N9V2 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRIML1Q8N9V2 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRIML1Q8N9V2 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRIML1Q8N9V2 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRIML1Q8N9V2 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRIML1Q8N9V2 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRIML1Q8N9V2 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRIML1Q8N9V2 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRIML1Q8N9V2 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRIML1Q8N9V2 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRIML1Q8N9V2 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRIML1Q8N9V2 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRIML1Q8N9V2 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRIML1Q8N9V2 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRIML1Q8N9V2 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
TRIML1Q8N9V2 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
TRIML1Q8N9V2 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRIML1Q8N9V2 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRIML1Q8N9V2 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRIML1Q8N9V2 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRIML1Q8N9V2 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRIML1Q8N9V2 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRIML1Q8N9V2 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRIML1Q8N9V2 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRIML1Q8N9V2 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRIML1Q8N9V2 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRIML1Q8N9V2 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRIML1Q8N9V2 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRIML1Q8N9V2 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRIML1Q8N9V2 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRIML1Q8N9V2 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
TRIML1Q8N9V2 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRIML1Q8N9V2 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRIML1Q8N9V2 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRIML1Q8N9V2 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRIML1Q8N9V2 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRIML1Q8N9V2 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRIML1Q8N9V2 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRIML1Q8N9V2 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRIML1Q8N9V2 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRIML1Q8N9V2 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRIML1Q8N9V2 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRIML1Q8N9V2 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRIML1Q8N9V2 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRIML1Q8N9V2 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRIML1Q8N9V2 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRIML1Q8N9V2 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRIML1Q8N9V2 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRIML1Q8N9V2 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRIML1Q8N9V2 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRIML1Q8N9V2 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
TRIML1Q8N9V2 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRIML1Q8N9V2 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRIML1Q8N9V2 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRIML1Q8N9V2 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRIML1Q8N9V2 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRIML1Q8N9V2 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRIML1Q8N9V2 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRIML1Q8N9V2 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRIML1Q8N9V2 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRIML1Q8N9V2 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRIML1Q8N9V2 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRIML1Q8N9V2 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRIML1Q8N9V2 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRIML1Q8N9V2 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRIML1Q8N9V2 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRIML1Q8N9V2 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRIML1Q8N9V2 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRIML1Q8N9V2 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRIML1Q8N9V2 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRIML1Q8N9V2 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
TRIML1Q8N9V2 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRIML1Q8N9V2 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRIML1Q8N9V2 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRIML1Q8N9V2 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRIML1Q8N9V2 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49 ms