Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6F7

GCSAM, Germinal center-associated signaling and motility protein, humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCSAMQ8N6F7 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GCSAMQ8N6F7 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GCSAMQ8N6F7 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GCSAMQ8N6F7 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GCSAMQ8N6F7 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GCSAMQ8N6F7 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
GCSAMQ8N6F7 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GCSAMQ8N6F7 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GCSAMQ8N6F7 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GCSAMQ8N6F7 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GCSAMQ8N6F7 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GCSAMQ8N6F7 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GCSAMQ8N6F7 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GCSAMQ8N6F7 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GCSAMQ8N6F7 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GCSAMQ8N6F7 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GCSAMQ8N6F7 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GCSAMQ8N6F7 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GCSAMQ8N6F7 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GCSAMQ8N6F7 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
GCSAMQ8N6F7 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GCSAMQ8N6F7 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GCSAMQ8N6F7 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
GCSAMQ8N6F7 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GCSAMQ8N6F7 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GCSAMQ8N6F7 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GCSAMQ8N6F7 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GCSAMQ8N6F7 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GCSAMQ8N6F7 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GCSAMQ8N6F7 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GCSAMQ8N6F7 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GCSAMQ8N6F7 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GCSAMQ8N6F7 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GCSAMQ8N6F7 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
GCSAMQ8N6F7 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
GCSAMQ8N6F7 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
GCSAMQ8N6F7 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
GCSAMQ8N6F7 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
GCSAMQ8N6F7 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
GCSAMQ8N6F7 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
GCSAMQ8N6F7 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GCSAMQ8N6F7 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GCSAMQ8N6F7 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
GCSAMQ8N6F7 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GCSAMQ8N6F7 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GCSAMQ8N6F7 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GCSAMQ8N6F7 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GCSAMQ8N6F7 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GCSAMQ8N6F7 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
GCSAMQ8N6F7 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GCSAMQ8N6F7 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GCSAMQ8N6F7 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GCSAMQ8N6F7 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GCSAMQ8N6F7 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GCSAMQ8N6F7 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GCSAMQ8N6F7 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GCSAMQ8N6F7 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GCSAMQ8N6F7 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GCSAMQ8N6F7 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GCSAMQ8N6F7 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GCSAMQ8N6F7 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GCSAMQ8N6F7 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GCSAMQ8N6F7 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GCSAMQ8N6F7 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GCSAMQ8N6F7 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GCSAMQ8N6F7 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GCSAMQ8N6F7 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GCSAMQ8N6F7 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GCSAMQ8N6F7 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GCSAMQ8N6F7 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GCSAMQ8N6F7 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GCSAMQ8N6F7 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GCSAMQ8N6F7 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GCSAMQ8N6F7 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GCSAMQ8N6F7 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GCSAMQ8N6F7 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GCSAMQ8N6F7 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GCSAMQ8N6F7 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
GCSAMQ8N6F7 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GCSAMQ8N6F7 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GCSAMQ8N6F7 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GCSAMQ8N6F7 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GCSAMQ8N6F7 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
GCSAMQ8N6F7 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GCSAMQ8N6F7 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GCSAMQ8N6F7 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GCSAMQ8N6F7 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GCSAMQ8N6F7 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GCSAMQ8N6F7 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GCSAMQ8N6F7 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GCSAMQ8N6F7 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GCSAMQ8N6F7 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GCSAMQ8N6F7 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GCSAMQ8N6F7 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GCSAMQ8N6F7 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GCSAMQ8N6F7 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GCSAMQ8N6F7 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GCSAMQ8N6F7 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GCSAMQ8N6F7 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GCSAMQ8N6F7 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 130.4 ms