Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4E4

PDCL2, Phosducin-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCL2Q8N4E4 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PDCL2Q8N4E4 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PDCL2Q8N4E4 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
PDCL2Q8N4E4 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PDCL2Q8N4E4 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PDCL2Q8N4E4 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PDCL2Q8N4E4 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PDCL2Q8N4E4 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PDCL2Q8N4E4 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PDCL2Q8N4E4 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PDCL2Q8N4E4 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PDCL2Q8N4E4 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PDCL2Q8N4E4 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PDCL2Q8N4E4 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PDCL2Q8N4E4 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PDCL2Q8N4E4 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PDCL2Q8N4E4 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PDCL2Q8N4E4 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PDCL2Q8N4E4 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PDCL2Q8N4E4 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PDCL2Q8N4E4 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PDCL2Q8N4E4 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PDCL2Q8N4E4 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PDCL2Q8N4E4 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PDCL2Q8N4E4 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PDCL2Q8N4E4 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PDCL2Q8N4E4 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PDCL2Q8N4E4 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PDCL2Q8N4E4 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PDCL2Q8N4E4 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PDCL2Q8N4E4 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
PDCL2Q8N4E4 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PDCL2Q8N4E4 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PDCL2Q8N4E4 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PDCL2Q8N4E4 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PDCL2Q8N4E4 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
PDCL2Q8N4E4 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PDCL2Q8N4E4 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
PDCL2Q8N4E4 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PDCL2Q8N4E4 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PDCL2Q8N4E4 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PDCL2Q8N4E4 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PDCL2Q8N4E4 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PDCL2Q8N4E4 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PDCL2Q8N4E4 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PDCL2Q8N4E4 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PDCL2Q8N4E4 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
PDCL2Q8N4E4 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PDCL2Q8N4E4 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PDCL2Q8N4E4 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PDCL2Q8N4E4 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PDCL2Q8N4E4 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PDCL2Q8N4E4 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PDCL2Q8N4E4 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PDCL2Q8N4E4 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PDCL2Q8N4E4 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PDCL2Q8N4E4 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PDCL2Q8N4E4 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PDCL2Q8N4E4 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PDCL2Q8N4E4 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PDCL2Q8N4E4 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PDCL2Q8N4E4 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PDCL2Q8N4E4 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PDCL2Q8N4E4 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PDCL2Q8N4E4 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PDCL2Q8N4E4 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PDCL2Q8N4E4 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
PDCL2Q8N4E4 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PDCL2Q8N4E4 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PDCL2Q8N4E4 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PDCL2Q8N4E4 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PDCL2Q8N4E4 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PDCL2Q8N4E4 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PDCL2Q8N4E4 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PDCL2Q8N4E4 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PDCL2Q8N4E4 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PDCL2Q8N4E4 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PDCL2Q8N4E4 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PDCL2Q8N4E4 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
PDCL2Q8N4E4 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PDCL2Q8N4E4 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PDCL2Q8N4E4 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PDCL2Q8N4E4 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PDCL2Q8N4E4 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PDCL2Q8N4E4 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PDCL2Q8N4E4 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PDCL2Q8N4E4 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PDCL2Q8N4E4 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
PDCL2Q8N4E4 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PDCL2Q8N4E4 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PDCL2Q8N4E4 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PDCL2Q8N4E4 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PDCL2Q8N4E4 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PDCL2Q8N4E4 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PDCL2Q8N4E4 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PDCL2Q8N4E4 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PDCL2Q8N4E4 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PDCL2Q8N4E4 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PDCL2Q8N4E4 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PDCL2Q8N4E4 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms