Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXW0

LMNTD2, Lamin tail domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNTD2Q8IXW0 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
LMNTD2Q8IXW0 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LMNTD2Q8IXW0 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LMNTD2Q8IXW0 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LMNTD2Q8IXW0 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LMNTD2Q8IXW0 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
LMNTD2Q8IXW0 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
LMNTD2Q8IXW0 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LMNTD2Q8IXW0 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LMNTD2Q8IXW0 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
LMNTD2Q8IXW0 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
LMNTD2Q8IXW0 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LMNTD2Q8IXW0 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LMNTD2Q8IXW0 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LMNTD2Q8IXW0 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LMNTD2Q8IXW0 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LMNTD2Q8IXW0 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LMNTD2Q8IXW0 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LMNTD2Q8IXW0 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LMNTD2Q8IXW0 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LMNTD2Q8IXW0 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LMNTD2Q8IXW0 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LMNTD2Q8IXW0 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LMNTD2Q8IXW0 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LMNTD2Q8IXW0 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LMNTD2Q8IXW0 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LMNTD2Q8IXW0 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LMNTD2Q8IXW0 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LMNTD2Q8IXW0 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
LMNTD2Q8IXW0 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LMNTD2Q8IXW0 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LMNTD2Q8IXW0 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LMNTD2Q8IXW0 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
LMNTD2Q8IXW0 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LMNTD2Q8IXW0 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LMNTD2Q8IXW0 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LMNTD2Q8IXW0 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LMNTD2Q8IXW0 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LMNTD2Q8IXW0 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
LMNTD2Q8IXW0 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LMNTD2Q8IXW0 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LMNTD2Q8IXW0 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
LMNTD2Q8IXW0 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LMNTD2Q8IXW0 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LMNTD2Q8IXW0 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LMNTD2Q8IXW0 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
LMNTD2Q8IXW0 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LMNTD2Q8IXW0 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LMNTD2Q8IXW0 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LMNTD2Q8IXW0 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LMNTD2Q8IXW0 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
LMNTD2Q8IXW0 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LMNTD2Q8IXW0 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
LMNTD2Q8IXW0 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
LMNTD2Q8IXW0 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LMNTD2Q8IXW0 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LMNTD2Q8IXW0 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LMNTD2Q8IXW0 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LMNTD2Q8IXW0 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
LMNTD2Q8IXW0 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
LMNTD2Q8IXW0 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LMNTD2Q8IXW0 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LMNTD2Q8IXW0 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LMNTD2Q8IXW0 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LMNTD2Q8IXW0 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
LMNTD2Q8IXW0 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LMNTD2Q8IXW0 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
LMNTD2Q8IXW0 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
LMNTD2Q8IXW0 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
LMNTD2Q8IXW0 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
LMNTD2Q8IXW0 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LMNTD2Q8IXW0 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
LMNTD2Q8IXW0 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
LMNTD2Q8IXW0 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LMNTD2Q8IXW0 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
LMNTD2Q8IXW0 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
LMNTD2Q8IXW0 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LMNTD2Q8IXW0 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
LMNTD2Q8IXW0 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
LMNTD2Q8IXW0 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LMNTD2Q8IXW0 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
LMNTD2Q8IXW0 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
LMNTD2Q8IXW0 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
LMNTD2Q8IXW0 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
LMNTD2Q8IXW0 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
LMNTD2Q8IXW0 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
LMNTD2Q8IXW0 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LMNTD2Q8IXW0 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LMNTD2Q8IXW0 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LMNTD2Q8IXW0 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
LMNTD2Q8IXW0 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
LMNTD2Q8IXW0 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
LMNTD2Q8IXW0 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
LMNTD2Q8IXW0 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
LMNTD2Q8IXW0 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
LMNTD2Q8IXW0 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
LMNTD2Q8IXW0 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
LMNTD2Q8IXW0 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
LMNTD2Q8IXW0 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
LMNTD2Q8IXW0 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms