Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXS6

PALM2, Paralemmin-2, humanhuman

Predictions only

Length 379 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PALM2Q8IXS6 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PALM2Q8IXS6 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PALM2Q8IXS6 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PALM2Q8IXS6 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PALM2Q8IXS6 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PALM2Q8IXS6 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PALM2Q8IXS6 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PALM2Q8IXS6 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PALM2Q8IXS6 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PALM2Q8IXS6 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PALM2Q8IXS6 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PALM2Q8IXS6 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PALM2Q8IXS6 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PALM2Q8IXS6 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PALM2Q8IXS6 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PALM2Q8IXS6 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PALM2Q8IXS6 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PALM2Q8IXS6 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PALM2Q8IXS6 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PALM2Q8IXS6 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PALM2Q8IXS6 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PALM2Q8IXS6 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PALM2Q8IXS6 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PALM2Q8IXS6 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PALM2Q8IXS6 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PALM2Q8IXS6 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PALM2Q8IXS6 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PALM2Q8IXS6 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PALM2Q8IXS6 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PALM2Q8IXS6 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PALM2Q8IXS6 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PALM2Q8IXS6 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PALM2Q8IXS6 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PALM2Q8IXS6 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PALM2Q8IXS6 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PALM2Q8IXS6 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PALM2Q8IXS6 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PALM2Q8IXS6 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PALM2Q8IXS6 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PALM2Q8IXS6 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PALM2Q8IXS6 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PALM2Q8IXS6 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PALM2Q8IXS6 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PALM2Q8IXS6 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PALM2Q8IXS6 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PALM2Q8IXS6 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PALM2Q8IXS6 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PALM2Q8IXS6 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PALM2Q8IXS6 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PALM2Q8IXS6 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PALM2Q8IXS6 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PALM2Q8IXS6 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PALM2Q8IXS6 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PALM2Q8IXS6 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PALM2Q8IXS6 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PALM2Q8IXS6 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PALM2Q8IXS6 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PALM2Q8IXS6 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PALM2Q8IXS6 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PALM2Q8IXS6 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PALM2Q8IXS6 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PALM2Q8IXS6 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PALM2Q8IXS6 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PALM2Q8IXS6 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PALM2Q8IXS6 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PALM2Q8IXS6 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PALM2Q8IXS6 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PALM2Q8IXS6 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PALM2Q8IXS6 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PALM2Q8IXS6 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PALM2Q8IXS6 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PALM2Q8IXS6 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PALM2Q8IXS6 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PALM2Q8IXS6 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PALM2Q8IXS6 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PALM2Q8IXS6 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PALM2Q8IXS6 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PALM2Q8IXS6 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PALM2Q8IXS6 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PALM2Q8IXS6 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PALM2Q8IXS6 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PALM2Q8IXS6 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PALM2Q8IXS6 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PALM2Q8IXS6 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PALM2Q8IXS6 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PALM2Q8IXS6 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PALM2Q8IXS6 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PALM2Q8IXS6 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PALM2Q8IXS6 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
PALM2Q8IXS6 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PALM2Q8IXS6 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PALM2Q8IXS6 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PALM2Q8IXS6 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PALM2Q8IXS6 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PALM2Q8IXS6 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PALM2Q8IXS6 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PALM2Q8IXS6 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PALM2Q8IXS6 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PALM2Q8IXS6 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PALM2Q8IXS6 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms