Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXH7

NELFCD, Negative elongation factor C/D, humanhuman

Predictions only

Length 590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NELFCDQ8IXH7 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NELFCDQ8IXH7 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NELFCDQ8IXH7 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NELFCDQ8IXH7 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NELFCDQ8IXH7 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NELFCDQ8IXH7 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NELFCDQ8IXH7 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NELFCDQ8IXH7 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NELFCDQ8IXH7 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NELFCDQ8IXH7 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NELFCDQ8IXH7 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NELFCDQ8IXH7 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NELFCDQ8IXH7 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NELFCDQ8IXH7 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NELFCDQ8IXH7 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NELFCDQ8IXH7 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NELFCDQ8IXH7 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NELFCDQ8IXH7 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NELFCDQ8IXH7 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NELFCDQ8IXH7 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NELFCDQ8IXH7 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NELFCDQ8IXH7 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NELFCDQ8IXH7 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NELFCDQ8IXH7 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NELFCDQ8IXH7 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NELFCDQ8IXH7 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NELFCDQ8IXH7 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NELFCDQ8IXH7 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NELFCDQ8IXH7 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NELFCDQ8IXH7 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NELFCDQ8IXH7 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NELFCDQ8IXH7 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
NELFCDQ8IXH7 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NELFCDQ8IXH7 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NELFCDQ8IXH7 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NELFCDQ8IXH7 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NELFCDQ8IXH7 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NELFCDQ8IXH7 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NELFCDQ8IXH7 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NELFCDQ8IXH7 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NELFCDQ8IXH7 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
NELFCDQ8IXH7 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
NELFCDQ8IXH7 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NELFCDQ8IXH7 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NELFCDQ8IXH7 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
NELFCDQ8IXH7 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NELFCDQ8IXH7 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NELFCDQ8IXH7 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NELFCDQ8IXH7 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NELFCDQ8IXH7 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NELFCDQ8IXH7 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NELFCDQ8IXH7 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NELFCDQ8IXH7 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
NELFCDQ8IXH7 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NELFCDQ8IXH7 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NELFCDQ8IXH7 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NELFCDQ8IXH7 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NELFCDQ8IXH7 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NELFCDQ8IXH7 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NELFCDQ8IXH7 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NELFCDQ8IXH7 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NELFCDQ8IXH7 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
NELFCDQ8IXH7 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NELFCDQ8IXH7 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NELFCDQ8IXH7 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NELFCDQ8IXH7 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NELFCDQ8IXH7 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NELFCDQ8IXH7 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NELFCDQ8IXH7 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NELFCDQ8IXH7 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NELFCDQ8IXH7 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NELFCDQ8IXH7 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NELFCDQ8IXH7 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NELFCDQ8IXH7 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NELFCDQ8IXH7 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
NELFCDQ8IXH7 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
NELFCDQ8IXH7 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NELFCDQ8IXH7 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NELFCDQ8IXH7 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NELFCDQ8IXH7 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NELFCDQ8IXH7 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NELFCDQ8IXH7 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
NELFCDQ8IXH7 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
NELFCDQ8IXH7 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
NELFCDQ8IXH7 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
NELFCDQ8IXH7 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
NELFCDQ8IXH7 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
NELFCDQ8IXH7 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
NELFCDQ8IXH7 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
NELFCDQ8IXH7 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
NELFCDQ8IXH7 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
NELFCDQ8IXH7 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
NELFCDQ8IXH7 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
NELFCDQ8IXH7 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
NELFCDQ8IXH7 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
NELFCDQ8IXH7 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
NELFCDQ8IXH7 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NELFCDQ8IXH7 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NELFCDQ8IXH7 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NELFCDQ8IXH7 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms