Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVF7

FMNL3, Formin-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,028 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FMNL3Q8IVF7 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FMNL3Q8IVF7 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FMNL3Q8IVF7 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
FMNL3Q8IVF7 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
FMNL3Q8IVF7 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FMNL3Q8IVF7 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
FMNL3Q8IVF7 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
FMNL3Q8IVF7 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
FMNL3Q8IVF7 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FMNL3Q8IVF7 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
FMNL3Q8IVF7 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
FMNL3Q8IVF7 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FMNL3Q8IVF7 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FMNL3Q8IVF7 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FMNL3Q8IVF7 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
FMNL3Q8IVF7 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FMNL3Q8IVF7 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
FMNL3Q8IVF7 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
FMNL3Q8IVF7 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
FMNL3Q8IVF7 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FMNL3Q8IVF7 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
FMNL3Q8IVF7 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FMNL3Q8IVF7 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FMNL3Q8IVF7 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FMNL3Q8IVF7 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
FMNL3Q8IVF7 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FMNL3Q8IVF7 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
FMNL3Q8IVF7 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FMNL3Q8IVF7 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FMNL3Q8IVF7 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
FMNL3Q8IVF7 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FMNL3Q8IVF7 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FMNL3Q8IVF7 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FMNL3Q8IVF7 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FMNL3Q8IVF7 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
FMNL3Q8IVF7 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FMNL3Q8IVF7 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FMNL3Q8IVF7 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FMNL3Q8IVF7 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FMNL3Q8IVF7 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
FMNL3Q8IVF7 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
FMNL3Q8IVF7 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FMNL3Q8IVF7 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
FMNL3Q8IVF7 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
FMNL3Q8IVF7 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FMNL3Q8IVF7 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
FMNL3Q8IVF7 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
FMNL3Q8IVF7 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
FMNL3Q8IVF7 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
FMNL3Q8IVF7 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
FMNL3Q8IVF7 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
FMNL3Q8IVF7 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
FMNL3Q8IVF7 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
FMNL3Q8IVF7 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
FMNL3Q8IVF7 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
FMNL3Q8IVF7 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
FMNL3Q8IVF7 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FMNL3Q8IVF7 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FMNL3Q8IVF7 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
FMNL3Q8IVF7 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FMNL3Q8IVF7 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FMNL3Q8IVF7 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FMNL3Q8IVF7 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FMNL3Q8IVF7 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
FMNL3Q8IVF7 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
FMNL3Q8IVF7 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FMNL3Q8IVF7 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FMNL3Q8IVF7 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
FMNL3Q8IVF7 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FMNL3Q8IVF7 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FMNL3Q8IVF7 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FMNL3Q8IVF7 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FMNL3Q8IVF7 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FMNL3Q8IVF7 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FMNL3Q8IVF7 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
FMNL3Q8IVF7 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FMNL3Q8IVF7 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FMNL3Q8IVF7 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FMNL3Q8IVF7 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
FMNL3Q8IVF7 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
FMNL3Q8IVF7 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FMNL3Q8IVF7 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
FMNL3Q8IVF7 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
FMNL3Q8IVF7 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
FMNL3Q8IVF7 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FMNL3Q8IVF7 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
FMNL3Q8IVF7 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
FMNL3Q8IVF7 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
FMNL3Q8IVF7 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
FMNL3Q8IVF7 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FMNL3Q8IVF7 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
FMNL3Q8IVF7 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FMNL3Q8IVF7 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FMNL3Q8IVF7 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FMNL3Q8IVF7 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FMNL3Q8IVF7 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FMNL3Q8IVF7 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FMNL3Q8IVF7 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FMNL3Q8IVF7 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
FMNL3Q8IVF7 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.6 ms