Protein–RNA interactions for Protein: Q8IUZ0

LRRC49, Leucine-rich repeat-containing protein 49, humanhuman

Predictions only

Length 686 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC49Q8IUZ0 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
LRRC49Q8IUZ0 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
LRRC49Q8IUZ0 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
LRRC49Q8IUZ0 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
LRRC49Q8IUZ0 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LRRC49Q8IUZ0 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LRRC49Q8IUZ0 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LRRC49Q8IUZ0 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LRRC49Q8IUZ0 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LRRC49Q8IUZ0 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LRRC49Q8IUZ0 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LRRC49Q8IUZ0 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LRRC49Q8IUZ0 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRRC49Q8IUZ0 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRRC49Q8IUZ0 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRRC49Q8IUZ0 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRRC49Q8IUZ0 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRRC49Q8IUZ0 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRRC49Q8IUZ0 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRRC49Q8IUZ0 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRRC49Q8IUZ0 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
LRRC49Q8IUZ0 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRRC49Q8IUZ0 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRRC49Q8IUZ0 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRRC49Q8IUZ0 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRRC49Q8IUZ0 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRRC49Q8IUZ0 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRRC49Q8IUZ0 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRRC49Q8IUZ0 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRRC49Q8IUZ0 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRRC49Q8IUZ0 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRRC49Q8IUZ0 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRRC49Q8IUZ0 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRRC49Q8IUZ0 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRRC49Q8IUZ0 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRRC49Q8IUZ0 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRRC49Q8IUZ0 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRRC49Q8IUZ0 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRRC49Q8IUZ0 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRRC49Q8IUZ0 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRRC49Q8IUZ0 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
LRRC49Q8IUZ0 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRRC49Q8IUZ0 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRRC49Q8IUZ0 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRRC49Q8IUZ0 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRRC49Q8IUZ0 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRRC49Q8IUZ0 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRRC49Q8IUZ0 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRRC49Q8IUZ0 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRRC49Q8IUZ0 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRRC49Q8IUZ0 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRRC49Q8IUZ0 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRRC49Q8IUZ0 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRRC49Q8IUZ0 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRRC49Q8IUZ0 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRRC49Q8IUZ0 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRRC49Q8IUZ0 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRRC49Q8IUZ0 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
LRRC49Q8IUZ0 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRRC49Q8IUZ0 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRRC49Q8IUZ0 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRRC49Q8IUZ0 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRRC49Q8IUZ0 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRRC49Q8IUZ0 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRRC49Q8IUZ0 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRRC49Q8IUZ0 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRRC49Q8IUZ0 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRRC49Q8IUZ0 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRRC49Q8IUZ0 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRRC49Q8IUZ0 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRRC49Q8IUZ0 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRRC49Q8IUZ0 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRRC49Q8IUZ0 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
LRRC49Q8IUZ0 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRRC49Q8IUZ0 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRRC49Q8IUZ0 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRRC49Q8IUZ0 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRRC49Q8IUZ0 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
LRRC49Q8IUZ0 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRRC49Q8IUZ0 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRRC49Q8IUZ0 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRRC49Q8IUZ0 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRRC49Q8IUZ0 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRRC49Q8IUZ0 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRRC49Q8IUZ0 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRRC49Q8IUZ0 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LRRC49Q8IUZ0 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LRRC49Q8IUZ0 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LRRC49Q8IUZ0 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LRRC49Q8IUZ0 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LRRC49Q8IUZ0 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LRRC49Q8IUZ0 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LRRC49Q8IUZ0 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
LRRC49Q8IUZ0 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
LRRC49Q8IUZ0 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
LRRC49Q8IUZ0 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
LRRC49Q8IUZ0 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRRC49Q8IUZ0 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRRC49Q8IUZ0 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRRC49Q8IUZ0 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.9 ms