Protein–RNA interactions for Protein: Q8IUX4

APOBEC3F, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3F, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 373 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3FQ8IUX4 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
APOBEC3FQ8IUX4 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
APOBEC3FQ8IUX4 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
APOBEC3FQ8IUX4 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
APOBEC3FQ8IUX4 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
APOBEC3FQ8IUX4 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
APOBEC3FQ8IUX4 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
APOBEC3FQ8IUX4 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
APOBEC3FQ8IUX4 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
APOBEC3FQ8IUX4 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
APOBEC3FQ8IUX4 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
APOBEC3FQ8IUX4 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
APOBEC3FQ8IUX4 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
APOBEC3FQ8IUX4 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
APOBEC3FQ8IUX4 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
APOBEC3FQ8IUX4 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC25.79■■□□□ 1.72
APOBEC3FQ8IUX4 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
APOBEC3FQ8IUX4 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC25.79■■□□□ 1.72
APOBEC3FQ8IUX4 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
APOBEC3FQ8IUX4 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
APOBEC3FQ8IUX4 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
APOBEC3FQ8IUX4 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
APOBEC3FQ8IUX4 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
APOBEC3FQ8IUX4 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
APOBEC3FQ8IUX4 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
APOBEC3FQ8IUX4 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
APOBEC3FQ8IUX4 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
APOBEC3FQ8IUX4 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
APOBEC3FQ8IUX4 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
APOBEC3FQ8IUX4 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
APOBEC3FQ8IUX4 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
APOBEC3FQ8IUX4 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
APOBEC3FQ8IUX4 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
APOBEC3FQ8IUX4 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
APOBEC3FQ8IUX4 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
APOBEC3FQ8IUX4 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
APOBEC3FQ8IUX4 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
APOBEC3FQ8IUX4 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
APOBEC3FQ8IUX4 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
APOBEC3FQ8IUX4 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
APOBEC3FQ8IUX4 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
APOBEC3FQ8IUX4 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
APOBEC3FQ8IUX4 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
APOBEC3FQ8IUX4 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
APOBEC3FQ8IUX4 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
APOBEC3FQ8IUX4 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
APOBEC3FQ8IUX4 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
APOBEC3FQ8IUX4 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
APOBEC3FQ8IUX4 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
APOBEC3FQ8IUX4 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
APOBEC3FQ8IUX4 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
APOBEC3FQ8IUX4 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
APOBEC3FQ8IUX4 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
APOBEC3FQ8IUX4 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
APOBEC3FQ8IUX4 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
APOBEC3FQ8IUX4 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
APOBEC3FQ8IUX4 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
APOBEC3FQ8IUX4 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
APOBEC3FQ8IUX4 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
APOBEC3FQ8IUX4 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
APOBEC3FQ8IUX4 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
APOBEC3FQ8IUX4 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
APOBEC3FQ8IUX4 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
APOBEC3FQ8IUX4 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
APOBEC3FQ8IUX4 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
APOBEC3FQ8IUX4 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
APOBEC3FQ8IUX4 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
APOBEC3FQ8IUX4 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
APOBEC3FQ8IUX4 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
APOBEC3FQ8IUX4 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
APOBEC3FQ8IUX4 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
APOBEC3FQ8IUX4 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
APOBEC3FQ8IUX4 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
APOBEC3FQ8IUX4 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
APOBEC3FQ8IUX4 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
APOBEC3FQ8IUX4 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
APOBEC3FQ8IUX4 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
APOBEC3FQ8IUX4 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
APOBEC3FQ8IUX4 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
APOBEC3FQ8IUX4 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
APOBEC3FQ8IUX4 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
APOBEC3FQ8IUX4 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
APOBEC3FQ8IUX4 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
APOBEC3FQ8IUX4 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC25.72■■□□□ 1.71
APOBEC3FQ8IUX4 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
APOBEC3FQ8IUX4 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
APOBEC3FQ8IUX4 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
APOBEC3FQ8IUX4 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
APOBEC3FQ8IUX4 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
APOBEC3FQ8IUX4 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
APOBEC3FQ8IUX4 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
APOBEC3FQ8IUX4 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
APOBEC3FQ8IUX4 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
APOBEC3FQ8IUX4 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
APOBEC3FQ8IUX4 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
APOBEC3FQ8IUX4 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
APOBEC3FQ8IUX4 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
APOBEC3FQ8IUX4 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
APOBEC3FQ8IUX4 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
APOBEC3FQ8IUX4 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms