Protein–RNA interactions for Protein: Q86VQ0

LCA5, Lebercilin, humanhuman

Predictions only

Length 697 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCA5Q86VQ0 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LCA5Q86VQ0 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LCA5Q86VQ0 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LCA5Q86VQ0 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LCA5Q86VQ0 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LCA5Q86VQ0 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LCA5Q86VQ0 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LCA5Q86VQ0 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LCA5Q86VQ0 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LCA5Q86VQ0 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LCA5Q86VQ0 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LCA5Q86VQ0 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LCA5Q86VQ0 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LCA5Q86VQ0 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LCA5Q86VQ0 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LCA5Q86VQ0 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LCA5Q86VQ0 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LCA5Q86VQ0 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LCA5Q86VQ0 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LCA5Q86VQ0 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LCA5Q86VQ0 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LCA5Q86VQ0 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LCA5Q86VQ0 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LCA5Q86VQ0 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LCA5Q86VQ0 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LCA5Q86VQ0 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LCA5Q86VQ0 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LCA5Q86VQ0 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LCA5Q86VQ0 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LCA5Q86VQ0 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LCA5Q86VQ0 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LCA5Q86VQ0 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LCA5Q86VQ0 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LCA5Q86VQ0 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LCA5Q86VQ0 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LCA5Q86VQ0 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LCA5Q86VQ0 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LCA5Q86VQ0 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LCA5Q86VQ0 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
LCA5Q86VQ0 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LCA5Q86VQ0 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
LCA5Q86VQ0 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LCA5Q86VQ0 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LCA5Q86VQ0 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LCA5Q86VQ0 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LCA5Q86VQ0 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
LCA5Q86VQ0 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LCA5Q86VQ0 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
LCA5Q86VQ0 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LCA5Q86VQ0 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
LCA5Q86VQ0 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LCA5Q86VQ0 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LCA5Q86VQ0 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LCA5Q86VQ0 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LCA5Q86VQ0 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LCA5Q86VQ0 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LCA5Q86VQ0 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LCA5Q86VQ0 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LCA5Q86VQ0 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LCA5Q86VQ0 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LCA5Q86VQ0 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LCA5Q86VQ0 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LCA5Q86VQ0 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LCA5Q86VQ0 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LCA5Q86VQ0 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LCA5Q86VQ0 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LCA5Q86VQ0 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LCA5Q86VQ0 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LCA5Q86VQ0 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LCA5Q86VQ0 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
LCA5Q86VQ0 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
LCA5Q86VQ0 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
LCA5Q86VQ0 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LCA5Q86VQ0 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LCA5Q86VQ0 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LCA5Q86VQ0 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LCA5Q86VQ0 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LCA5Q86VQ0 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LCA5Q86VQ0 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LCA5Q86VQ0 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LCA5Q86VQ0 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LCA5Q86VQ0 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LCA5Q86VQ0 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
LCA5Q86VQ0 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LCA5Q86VQ0 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LCA5Q86VQ0 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LCA5Q86VQ0 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LCA5Q86VQ0 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LCA5Q86VQ0 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LCA5Q86VQ0 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LCA5Q86VQ0 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LCA5Q86VQ0 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LCA5Q86VQ0 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LCA5Q86VQ0 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LCA5Q86VQ0 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LCA5Q86VQ0 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LCA5Q86VQ0 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LCA5Q86VQ0 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LCA5Q86VQ0 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LCA5Q86VQ0 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms