Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3B4

NUP54, Nucleoporin p54, humanhuman

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP54Q7Z3B4 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
NUP54Q7Z3B4 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
NUP54Q7Z3B4 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
NUP54Q7Z3B4 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
NUP54Q7Z3B4 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
NUP54Q7Z3B4 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
NUP54Q7Z3B4 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NUP54Q7Z3B4 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
NUP54Q7Z3B4 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NUP54Q7Z3B4 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NUP54Q7Z3B4 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
NUP54Q7Z3B4 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NUP54Q7Z3B4 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
NUP54Q7Z3B4 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NUP54Q7Z3B4 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
NUP54Q7Z3B4 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
NUP54Q7Z3B4 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
NUP54Q7Z3B4 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NUP54Q7Z3B4 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
NUP54Q7Z3B4 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NUP54Q7Z3B4 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NUP54Q7Z3B4 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
NUP54Q7Z3B4 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NUP54Q7Z3B4 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
NUP54Q7Z3B4 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
NUP54Q7Z3B4 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
NUP54Q7Z3B4 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
NUP54Q7Z3B4 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NUP54Q7Z3B4 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
NUP54Q7Z3B4 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
NUP54Q7Z3B4 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NUP54Q7Z3B4 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
NUP54Q7Z3B4 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NUP54Q7Z3B4 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NUP54Q7Z3B4 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
NUP54Q7Z3B4 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NUP54Q7Z3B4 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
NUP54Q7Z3B4 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NUP54Q7Z3B4 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
NUP54Q7Z3B4 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
NUP54Q7Z3B4 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NUP54Q7Z3B4 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NUP54Q7Z3B4 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NUP54Q7Z3B4 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NUP54Q7Z3B4 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NUP54Q7Z3B4 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NUP54Q7Z3B4 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
NUP54Q7Z3B4 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC20■□□□□ 0.79
NUP54Q7Z3B4 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20■□□□□ 0.79
NUP54Q7Z3B4 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
NUP54Q7Z3B4 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
NUP54Q7Z3B4 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
NUP54Q7Z3B4 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NUP54Q7Z3B4 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
NUP54Q7Z3B4 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
NUP54Q7Z3B4 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NUP54Q7Z3B4 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
NUP54Q7Z3B4 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NUP54Q7Z3B4 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NUP54Q7Z3B4 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
NUP54Q7Z3B4 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
NUP54Q7Z3B4 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
NUP54Q7Z3B4 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC19.99■□□□□ 0.79
NUP54Q7Z3B4 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NUP54Q7Z3B4 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
NUP54Q7Z3B4 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NUP54Q7Z3B4 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NUP54Q7Z3B4 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
NUP54Q7Z3B4 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
NUP54Q7Z3B4 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NUP54Q7Z3B4 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NUP54Q7Z3B4 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
NUP54Q7Z3B4 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NUP54Q7Z3B4 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NUP54Q7Z3B4 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NUP54Q7Z3B4 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NUP54Q7Z3B4 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NUP54Q7Z3B4 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NUP54Q7Z3B4 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
NUP54Q7Z3B4 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
NUP54Q7Z3B4 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
NUP54Q7Z3B4 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NUP54Q7Z3B4 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NUP54Q7Z3B4 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NUP54Q7Z3B4 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
NUP54Q7Z3B4 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NUP54Q7Z3B4 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
NUP54Q7Z3B4 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NUP54Q7Z3B4 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NUP54Q7Z3B4 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NUP54Q7Z3B4 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NUP54Q7Z3B4 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NUP54Q7Z3B4 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NUP54Q7Z3B4 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
NUP54Q7Z3B4 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
NUP54Q7Z3B4 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NUP54Q7Z3B4 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NUP54Q7Z3B4 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NUP54Q7Z3B4 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
NUP54Q7Z3B4 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms