Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z2E3

APTX, Aprataxin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APTXQ7Z2E3 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
APTXQ7Z2E3 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
APTXQ7Z2E3 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
APTXQ7Z2E3 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
APTXQ7Z2E3 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
APTXQ7Z2E3 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
APTXQ7Z2E3 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
APTXQ7Z2E3 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
APTXQ7Z2E3 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
APTXQ7Z2E3 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
APTXQ7Z2E3 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
APTXQ7Z2E3 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
APTXQ7Z2E3 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
APTXQ7Z2E3 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
APTXQ7Z2E3 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
APTXQ7Z2E3 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
APTXQ7Z2E3 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
APTXQ7Z2E3 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
APTXQ7Z2E3 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
APTXQ7Z2E3 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
APTXQ7Z2E3 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
APTXQ7Z2E3 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
APTXQ7Z2E3 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
APTXQ7Z2E3 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
APTXQ7Z2E3 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
APTXQ7Z2E3 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
APTXQ7Z2E3 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
APTXQ7Z2E3 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
APTXQ7Z2E3 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
APTXQ7Z2E3 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
APTXQ7Z2E3 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
APTXQ7Z2E3 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
APTXQ7Z2E3 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
APTXQ7Z2E3 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
APTXQ7Z2E3 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
APTXQ7Z2E3 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
APTXQ7Z2E3 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
APTXQ7Z2E3 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
APTXQ7Z2E3 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
APTXQ7Z2E3 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
APTXQ7Z2E3 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
APTXQ7Z2E3 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
APTXQ7Z2E3 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
APTXQ7Z2E3 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
APTXQ7Z2E3 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
APTXQ7Z2E3 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
APTXQ7Z2E3 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
APTXQ7Z2E3 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
APTXQ7Z2E3 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
APTXQ7Z2E3 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
APTXQ7Z2E3 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
APTXQ7Z2E3 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
APTXQ7Z2E3 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
APTXQ7Z2E3 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
APTXQ7Z2E3 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
APTXQ7Z2E3 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
APTXQ7Z2E3 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
APTXQ7Z2E3 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
APTXQ7Z2E3 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
APTXQ7Z2E3 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
APTXQ7Z2E3 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
APTXQ7Z2E3 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
APTXQ7Z2E3 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
APTXQ7Z2E3 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
APTXQ7Z2E3 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
APTXQ7Z2E3 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
APTXQ7Z2E3 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
APTXQ7Z2E3 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
APTXQ7Z2E3 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
APTXQ7Z2E3 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
APTXQ7Z2E3 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
APTXQ7Z2E3 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
APTXQ7Z2E3 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
APTXQ7Z2E3 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
APTXQ7Z2E3 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
APTXQ7Z2E3 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
APTXQ7Z2E3 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
APTXQ7Z2E3 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
APTXQ7Z2E3 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
APTXQ7Z2E3 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
APTXQ7Z2E3 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
APTXQ7Z2E3 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
APTXQ7Z2E3 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
APTXQ7Z2E3 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
APTXQ7Z2E3 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
APTXQ7Z2E3 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
APTXQ7Z2E3 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
APTXQ7Z2E3 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
APTXQ7Z2E3 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
APTXQ7Z2E3 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
APTXQ7Z2E3 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
APTXQ7Z2E3 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
APTXQ7Z2E3 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
APTXQ7Z2E3 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
APTXQ7Z2E3 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
APTXQ7Z2E3 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
APTXQ7Z2E3 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
APTXQ7Z2E3 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
APTXQ7Z2E3 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
APTXQ7Z2E3 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms