Protein–RNA interactions for Protein: Q7L1I2

SV2B, Synaptic vesicle glycoprotein 2B, humanhuman

Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SV2BQ7L1I2 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SV2BQ7L1I2 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SV2BQ7L1I2 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SV2BQ7L1I2 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SV2BQ7L1I2 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SV2BQ7L1I2 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SV2BQ7L1I2 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SV2BQ7L1I2 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SV2BQ7L1I2 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SV2BQ7L1I2 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SV2BQ7L1I2 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SV2BQ7L1I2 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SV2BQ7L1I2 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SV2BQ7L1I2 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SV2BQ7L1I2 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SV2BQ7L1I2 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SV2BQ7L1I2 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SV2BQ7L1I2 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
SV2BQ7L1I2 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SV2BQ7L1I2 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SV2BQ7L1I2 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SV2BQ7L1I2 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SV2BQ7L1I2 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SV2BQ7L1I2 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SV2BQ7L1I2 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SV2BQ7L1I2 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
SV2BQ7L1I2 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SV2BQ7L1I2 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
SV2BQ7L1I2 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SV2BQ7L1I2 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SV2BQ7L1I2 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SV2BQ7L1I2 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SV2BQ7L1I2 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SV2BQ7L1I2 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
SV2BQ7L1I2 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
SV2BQ7L1I2 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SV2BQ7L1I2 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SV2BQ7L1I2 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SV2BQ7L1I2 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SV2BQ7L1I2 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SV2BQ7L1I2 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SV2BQ7L1I2 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SV2BQ7L1I2 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
SV2BQ7L1I2 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
SV2BQ7L1I2 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SV2BQ7L1I2 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SV2BQ7L1I2 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SV2BQ7L1I2 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SV2BQ7L1I2 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SV2BQ7L1I2 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SV2BQ7L1I2 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SV2BQ7L1I2 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SV2BQ7L1I2 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SV2BQ7L1I2 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SV2BQ7L1I2 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SV2BQ7L1I2 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SV2BQ7L1I2 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SV2BQ7L1I2 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SV2BQ7L1I2 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SV2BQ7L1I2 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SV2BQ7L1I2 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SV2BQ7L1I2 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
SV2BQ7L1I2 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SV2BQ7L1I2 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SV2BQ7L1I2 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SV2BQ7L1I2 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SV2BQ7L1I2 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SV2BQ7L1I2 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SV2BQ7L1I2 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SV2BQ7L1I2 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SV2BQ7L1I2 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SV2BQ7L1I2 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SV2BQ7L1I2 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SV2BQ7L1I2 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SV2BQ7L1I2 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SV2BQ7L1I2 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SV2BQ7L1I2 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SV2BQ7L1I2 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SV2BQ7L1I2 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SV2BQ7L1I2 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SV2BQ7L1I2 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SV2BQ7L1I2 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SV2BQ7L1I2 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SV2BQ7L1I2 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SV2BQ7L1I2 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SV2BQ7L1I2 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SV2BQ7L1I2 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SV2BQ7L1I2 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SV2BQ7L1I2 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SV2BQ7L1I2 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SV2BQ7L1I2 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SV2BQ7L1I2 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SV2BQ7L1I2 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
SV2BQ7L1I2 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SV2BQ7L1I2 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SV2BQ7L1I2 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SV2BQ7L1I2 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SV2BQ7L1I2 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SV2BQ7L1I2 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SV2BQ7L1I2 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms