Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZSI9

CAPN12, Calpain-12, humanhuman

Predictions only

Length 719 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN12Q6ZSI9 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CAPN12Q6ZSI9 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CAPN12Q6ZSI9 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CAPN12Q6ZSI9 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CAPN12Q6ZSI9 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CAPN12Q6ZSI9 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CAPN12Q6ZSI9 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CAPN12Q6ZSI9 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CAPN12Q6ZSI9 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CAPN12Q6ZSI9 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CAPN12Q6ZSI9 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CAPN12Q6ZSI9 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CAPN12Q6ZSI9 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CAPN12Q6ZSI9 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CAPN12Q6ZSI9 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CAPN12Q6ZSI9 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CAPN12Q6ZSI9 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CAPN12Q6ZSI9 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CAPN12Q6ZSI9 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CAPN12Q6ZSI9 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CAPN12Q6ZSI9 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CAPN12Q6ZSI9 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CAPN12Q6ZSI9 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CAPN12Q6ZSI9 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CAPN12Q6ZSI9 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CAPN12Q6ZSI9 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CAPN12Q6ZSI9 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CAPN12Q6ZSI9 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CAPN12Q6ZSI9 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CAPN12Q6ZSI9 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CAPN12Q6ZSI9 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CAPN12Q6ZSI9 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CAPN12Q6ZSI9 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CAPN12Q6ZSI9 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CAPN12Q6ZSI9 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CAPN12Q6ZSI9 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CAPN12Q6ZSI9 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CAPN12Q6ZSI9 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CAPN12Q6ZSI9 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CAPN12Q6ZSI9 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CAPN12Q6ZSI9 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CAPN12Q6ZSI9 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CAPN12Q6ZSI9 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CAPN12Q6ZSI9 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CAPN12Q6ZSI9 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CAPN12Q6ZSI9 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CAPN12Q6ZSI9 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CAPN12Q6ZSI9 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CAPN12Q6ZSI9 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CAPN12Q6ZSI9 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CAPN12Q6ZSI9 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CAPN12Q6ZSI9 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CAPN12Q6ZSI9 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CAPN12Q6ZSI9 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CAPN12Q6ZSI9 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CAPN12Q6ZSI9 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CAPN12Q6ZSI9 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CAPN12Q6ZSI9 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CAPN12Q6ZSI9 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CAPN12Q6ZSI9 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CAPN12Q6ZSI9 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CAPN12Q6ZSI9 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CAPN12Q6ZSI9 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CAPN12Q6ZSI9 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CAPN12Q6ZSI9 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CAPN12Q6ZSI9 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CAPN12Q6ZSI9 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CAPN12Q6ZSI9 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CAPN12Q6ZSI9 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CAPN12Q6ZSI9 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CAPN12Q6ZSI9 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CAPN12Q6ZSI9 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CAPN12Q6ZSI9 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CAPN12Q6ZSI9 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CAPN12Q6ZSI9 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CAPN12Q6ZSI9 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CAPN12Q6ZSI9 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CAPN12Q6ZSI9 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CAPN12Q6ZSI9 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CAPN12Q6ZSI9 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CAPN12Q6ZSI9 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CAPN12Q6ZSI9 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CAPN12Q6ZSI9 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CAPN12Q6ZSI9 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CAPN12Q6ZSI9 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CAPN12Q6ZSI9 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CAPN12Q6ZSI9 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CAPN12Q6ZSI9 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CAPN12Q6ZSI9 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CAPN12Q6ZSI9 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CAPN12Q6ZSI9 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CAPN12Q6ZSI9 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CAPN12Q6ZSI9 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CAPN12Q6ZSI9 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CAPN12Q6ZSI9 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CAPN12Q6ZSI9 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CAPN12Q6ZSI9 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CAPN12Q6ZSI9 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CAPN12Q6ZSI9 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CAPN12Q6ZSI9 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms