Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRK6

CCDC73, Coiled-coil domain-containing protein 73, humanhuman

Predictions only

Length 1,079 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC73Q6ZRK6 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC73Q6ZRK6 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC73Q6ZRK6 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC73Q6ZRK6 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC73Q6ZRK6 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC73Q6ZRK6 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC73Q6ZRK6 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC73Q6ZRK6 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC73Q6ZRK6 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC73Q6ZRK6 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC73Q6ZRK6 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC73Q6ZRK6 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC73Q6ZRK6 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC73Q6ZRK6 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC73Q6ZRK6 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC73Q6ZRK6 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC73Q6ZRK6 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC73Q6ZRK6 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC73Q6ZRK6 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC73Q6ZRK6 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC73Q6ZRK6 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC73Q6ZRK6 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC73Q6ZRK6 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC73Q6ZRK6 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC73Q6ZRK6 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC73Q6ZRK6 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC73Q6ZRK6 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC73Q6ZRK6 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC73Q6ZRK6 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC73Q6ZRK6 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC73Q6ZRK6 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC73Q6ZRK6 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC73Q6ZRK6 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC73Q6ZRK6 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC73Q6ZRK6 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC73Q6ZRK6 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC73Q6ZRK6 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC73Q6ZRK6 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC73Q6ZRK6 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC73Q6ZRK6 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC73Q6ZRK6 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC73Q6ZRK6 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC73Q6ZRK6 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC73Q6ZRK6 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC73Q6ZRK6 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC73Q6ZRK6 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC73Q6ZRK6 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC73Q6ZRK6 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC73Q6ZRK6 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC73Q6ZRK6 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC73Q6ZRK6 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC73Q6ZRK6 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC73Q6ZRK6 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC73Q6ZRK6 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC73Q6ZRK6 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC73Q6ZRK6 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC73Q6ZRK6 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC73Q6ZRK6 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC73Q6ZRK6 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC73Q6ZRK6 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC73Q6ZRK6 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC73Q6ZRK6 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC73Q6ZRK6 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC73Q6ZRK6 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC73Q6ZRK6 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC73Q6ZRK6 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC73Q6ZRK6 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC73Q6ZRK6 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC73Q6ZRK6 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC73Q6ZRK6 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC73Q6ZRK6 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC73Q6ZRK6 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC73Q6ZRK6 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC73Q6ZRK6 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC73Q6ZRK6 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC73Q6ZRK6 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC73Q6ZRK6 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC73Q6ZRK6 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC73Q6ZRK6 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC73Q6ZRK6 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC73Q6ZRK6 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC73Q6ZRK6 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC73Q6ZRK6 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC73Q6ZRK6 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC73Q6ZRK6 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC73Q6ZRK6 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC73Q6ZRK6 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC73Q6ZRK6 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC73Q6ZRK6 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC73Q6ZRK6 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC73Q6ZRK6 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC73Q6ZRK6 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC73Q6ZRK6 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC73Q6ZRK6 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC73Q6ZRK6 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC73Q6ZRK6 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC73Q6ZRK6 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC73Q6ZRK6 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC73Q6ZRK6 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC73Q6ZRK6 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms