Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMY3

SPOCD1, SPOC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCD1Q6ZMY3 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SPOCD1Q6ZMY3 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SPOCD1Q6ZMY3 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SPOCD1Q6ZMY3 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SPOCD1Q6ZMY3 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SPOCD1Q6ZMY3 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SPOCD1Q6ZMY3 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SPOCD1Q6ZMY3 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SPOCD1Q6ZMY3 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SPOCD1Q6ZMY3 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SPOCD1Q6ZMY3 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
SPOCD1Q6ZMY3 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SPOCD1Q6ZMY3 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SPOCD1Q6ZMY3 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SPOCD1Q6ZMY3 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SPOCD1Q6ZMY3 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SPOCD1Q6ZMY3 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SPOCD1Q6ZMY3 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SPOCD1Q6ZMY3 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SPOCD1Q6ZMY3 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SPOCD1Q6ZMY3 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SPOCD1Q6ZMY3 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
SPOCD1Q6ZMY3 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
SPOCD1Q6ZMY3 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
SPOCD1Q6ZMY3 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SPOCD1Q6ZMY3 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SPOCD1Q6ZMY3 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SPOCD1Q6ZMY3 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SPOCD1Q6ZMY3 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SPOCD1Q6ZMY3 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SPOCD1Q6ZMY3 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SPOCD1Q6ZMY3 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SPOCD1Q6ZMY3 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SPOCD1Q6ZMY3 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SPOCD1Q6ZMY3 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SPOCD1Q6ZMY3 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SPOCD1Q6ZMY3 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SPOCD1Q6ZMY3 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SPOCD1Q6ZMY3 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SPOCD1Q6ZMY3 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SPOCD1Q6ZMY3 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SPOCD1Q6ZMY3 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SPOCD1Q6ZMY3 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SPOCD1Q6ZMY3 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SPOCD1Q6ZMY3 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SPOCD1Q6ZMY3 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SPOCD1Q6ZMY3 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SPOCD1Q6ZMY3 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SPOCD1Q6ZMY3 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SPOCD1Q6ZMY3 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SPOCD1Q6ZMY3 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SPOCD1Q6ZMY3 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SPOCD1Q6ZMY3 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SPOCD1Q6ZMY3 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SPOCD1Q6ZMY3 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SPOCD1Q6ZMY3 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SPOCD1Q6ZMY3 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SPOCD1Q6ZMY3 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SPOCD1Q6ZMY3 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SPOCD1Q6ZMY3 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SPOCD1Q6ZMY3 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SPOCD1Q6ZMY3 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SPOCD1Q6ZMY3 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SPOCD1Q6ZMY3 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SPOCD1Q6ZMY3 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SPOCD1Q6ZMY3 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SPOCD1Q6ZMY3 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SPOCD1Q6ZMY3 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SPOCD1Q6ZMY3 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SPOCD1Q6ZMY3 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SPOCD1Q6ZMY3 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SPOCD1Q6ZMY3 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SPOCD1Q6ZMY3 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SPOCD1Q6ZMY3 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SPOCD1Q6ZMY3 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SPOCD1Q6ZMY3 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SPOCD1Q6ZMY3 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SPOCD1Q6ZMY3 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SPOCD1Q6ZMY3 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SPOCD1Q6ZMY3 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SPOCD1Q6ZMY3 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SPOCD1Q6ZMY3 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SPOCD1Q6ZMY3 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SPOCD1Q6ZMY3 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SPOCD1Q6ZMY3 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SPOCD1Q6ZMY3 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SPOCD1Q6ZMY3 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SPOCD1Q6ZMY3 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SPOCD1Q6ZMY3 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SPOCD1Q6ZMY3 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SPOCD1Q6ZMY3 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SPOCD1Q6ZMY3 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SPOCD1Q6ZMY3 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SPOCD1Q6ZMY3 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SPOCD1Q6ZMY3 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SPOCD1Q6ZMY3 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
SPOCD1Q6ZMY3 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SPOCD1Q6ZMY3 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SPOCD1Q6ZMY3 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SPOCD1Q6ZMY3 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms