Protein–RNA interactions for Protein: Q6X4W1

NSMF, NMDA receptor synaptonuclear signaling and neuronal migration factor, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSMFQ6X4W1 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NSMFQ6X4W1 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NSMFQ6X4W1 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NSMFQ6X4W1 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NSMFQ6X4W1 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NSMFQ6X4W1 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NSMFQ6X4W1 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NSMFQ6X4W1 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
NSMFQ6X4W1 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
NSMFQ6X4W1 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
NSMFQ6X4W1 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NSMFQ6X4W1 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NSMFQ6X4W1 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NSMFQ6X4W1 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NSMFQ6X4W1 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NSMFQ6X4W1 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
NSMFQ6X4W1 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NSMFQ6X4W1 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NSMFQ6X4W1 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NSMFQ6X4W1 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NSMFQ6X4W1 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NSMFQ6X4W1 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NSMFQ6X4W1 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NSMFQ6X4W1 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NSMFQ6X4W1 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NSMFQ6X4W1 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NSMFQ6X4W1 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NSMFQ6X4W1 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NSMFQ6X4W1 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NSMFQ6X4W1 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NSMFQ6X4W1 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NSMFQ6X4W1 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NSMFQ6X4W1 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NSMFQ6X4W1 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
NSMFQ6X4W1 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NSMFQ6X4W1 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NSMFQ6X4W1 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
NSMFQ6X4W1 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NSMFQ6X4W1 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NSMFQ6X4W1 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NSMFQ6X4W1 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NSMFQ6X4W1 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NSMFQ6X4W1 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NSMFQ6X4W1 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NSMFQ6X4W1 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
NSMFQ6X4W1 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NSMFQ6X4W1 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NSMFQ6X4W1 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NSMFQ6X4W1 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NSMFQ6X4W1 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NSMFQ6X4W1 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NSMFQ6X4W1 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NSMFQ6X4W1 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NSMFQ6X4W1 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NSMFQ6X4W1 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NSMFQ6X4W1 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NSMFQ6X4W1 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NSMFQ6X4W1 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NSMFQ6X4W1 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NSMFQ6X4W1 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NSMFQ6X4W1 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NSMFQ6X4W1 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NSMFQ6X4W1 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NSMFQ6X4W1 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NSMFQ6X4W1 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NSMFQ6X4W1 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NSMFQ6X4W1 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NSMFQ6X4W1 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NSMFQ6X4W1 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NSMFQ6X4W1 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NSMFQ6X4W1 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NSMFQ6X4W1 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NSMFQ6X4W1 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NSMFQ6X4W1 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NSMFQ6X4W1 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NSMFQ6X4W1 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
NSMFQ6X4W1 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NSMFQ6X4W1 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NSMFQ6X4W1 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NSMFQ6X4W1 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
NSMFQ6X4W1 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NSMFQ6X4W1 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NSMFQ6X4W1 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NSMFQ6X4W1 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NSMFQ6X4W1 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NSMFQ6X4W1 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NSMFQ6X4W1 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NSMFQ6X4W1 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NSMFQ6X4W1 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NSMFQ6X4W1 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NSMFQ6X4W1 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NSMFQ6X4W1 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NSMFQ6X4W1 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NSMFQ6X4W1 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NSMFQ6X4W1 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NSMFQ6X4W1 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NSMFQ6X4W1 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NSMFQ6X4W1 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NSMFQ6X4W1 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NSMFQ6X4W1 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms