Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXS9

CASP12, Inactive caspase-12, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP12Q6UXS9 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CASP12Q6UXS9 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CASP12Q6UXS9 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CASP12Q6UXS9 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CASP12Q6UXS9 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CASP12Q6UXS9 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
CASP12Q6UXS9 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CASP12Q6UXS9 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CASP12Q6UXS9 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CASP12Q6UXS9 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CASP12Q6UXS9 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CASP12Q6UXS9 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CASP12Q6UXS9 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CASP12Q6UXS9 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CASP12Q6UXS9 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CASP12Q6UXS9 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CASP12Q6UXS9 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CASP12Q6UXS9 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CASP12Q6UXS9 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CASP12Q6UXS9 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CASP12Q6UXS9 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CASP12Q6UXS9 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CASP12Q6UXS9 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CASP12Q6UXS9 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CASP12Q6UXS9 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CASP12Q6UXS9 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CASP12Q6UXS9 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CASP12Q6UXS9 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CASP12Q6UXS9 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CASP12Q6UXS9 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CASP12Q6UXS9 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CASP12Q6UXS9 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CASP12Q6UXS9 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CASP12Q6UXS9 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CASP12Q6UXS9 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CASP12Q6UXS9 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CASP12Q6UXS9 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CASP12Q6UXS9 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
CASP12Q6UXS9 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CASP12Q6UXS9 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CASP12Q6UXS9 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CASP12Q6UXS9 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CASP12Q6UXS9 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CASP12Q6UXS9 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CASP12Q6UXS9 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CASP12Q6UXS9 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CASP12Q6UXS9 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CASP12Q6UXS9 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CASP12Q6UXS9 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CASP12Q6UXS9 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CASP12Q6UXS9 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CASP12Q6UXS9 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CASP12Q6UXS9 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CASP12Q6UXS9 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC20.02■□□□□ 0.79
CASP12Q6UXS9 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CASP12Q6UXS9 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CASP12Q6UXS9 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CASP12Q6UXS9 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CASP12Q6UXS9 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CASP12Q6UXS9 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CASP12Q6UXS9 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CASP12Q6UXS9 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CASP12Q6UXS9 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CASP12Q6UXS9 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CASP12Q6UXS9 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CASP12Q6UXS9 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CASP12Q6UXS9 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CASP12Q6UXS9 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CASP12Q6UXS9 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CASP12Q6UXS9 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CASP12Q6UXS9 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CASP12Q6UXS9 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC20■□□□□ 0.79
CASP12Q6UXS9 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CASP12Q6UXS9 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
CASP12Q6UXS9 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC20■□□□□ 0.79
CASP12Q6UXS9 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC20■□□□□ 0.79
CASP12Q6UXS9 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CASP12Q6UXS9 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CASP12Q6UXS9 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CASP12Q6UXS9 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CASP12Q6UXS9 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CASP12Q6UXS9 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CASP12Q6UXS9 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CASP12Q6UXS9 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CASP12Q6UXS9 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CASP12Q6UXS9 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CASP12Q6UXS9 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CASP12Q6UXS9 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CASP12Q6UXS9 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CASP12Q6UXS9 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CASP12Q6UXS9 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CASP12Q6UXS9 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CASP12Q6UXS9 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CASP12Q6UXS9 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CASP12Q6UXS9 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CASP12Q6UXS9 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CASP12Q6UXS9 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CASP12Q6UXS9 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CASP12Q6UXS9 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CASP12Q6UXS9 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms