Protein–RNA interactions for Protein: Q6RFH8

DUX4L9, Double homeobox protein 4C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUX4L9Q6RFH8 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
DUX4L9Q6RFH8 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
DUX4L9Q6RFH8 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
DUX4L9Q6RFH8 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
DUX4L9Q6RFH8 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
DUX4L9Q6RFH8 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
DUX4L9Q6RFH8 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
DUX4L9Q6RFH8 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
DUX4L9Q6RFH8 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
DUX4L9Q6RFH8 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
DUX4L9Q6RFH8 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
DUX4L9Q6RFH8 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
DUX4L9Q6RFH8 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
DUX4L9Q6RFH8 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
DUX4L9Q6RFH8 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
DUX4L9Q6RFH8 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
DUX4L9Q6RFH8 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
DUX4L9Q6RFH8 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
DUX4L9Q6RFH8 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
DUX4L9Q6RFH8 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
DUX4L9Q6RFH8 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
DUX4L9Q6RFH8 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
DUX4L9Q6RFH8 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
DUX4L9Q6RFH8 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
DUX4L9Q6RFH8 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
DUX4L9Q6RFH8 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
DUX4L9Q6RFH8 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
DUX4L9Q6RFH8 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
DUX4L9Q6RFH8 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
DUX4L9Q6RFH8 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
DUX4L9Q6RFH8 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
DUX4L9Q6RFH8 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
DUX4L9Q6RFH8 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
DUX4L9Q6RFH8 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DUX4L9Q6RFH8 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DUX4L9Q6RFH8 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DUX4L9Q6RFH8 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DUX4L9Q6RFH8 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
DUX4L9Q6RFH8 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DUX4L9Q6RFH8 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
DUX4L9Q6RFH8 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DUX4L9Q6RFH8 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DUX4L9Q6RFH8 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DUX4L9Q6RFH8 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
DUX4L9Q6RFH8 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DUX4L9Q6RFH8 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
DUX4L9Q6RFH8 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
DUX4L9Q6RFH8 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
DUX4L9Q6RFH8 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
DUX4L9Q6RFH8 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DUX4L9Q6RFH8 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
DUX4L9Q6RFH8 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
DUX4L9Q6RFH8 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
DUX4L9Q6RFH8 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DUX4L9Q6RFH8 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DUX4L9Q6RFH8 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
DUX4L9Q6RFH8 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
DUX4L9Q6RFH8 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
DUX4L9Q6RFH8 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
DUX4L9Q6RFH8 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
DUX4L9Q6RFH8 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DUX4L9Q6RFH8 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
DUX4L9Q6RFH8 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DUX4L9Q6RFH8 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
DUX4L9Q6RFH8 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
DUX4L9Q6RFH8 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DUX4L9Q6RFH8 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
DUX4L9Q6RFH8 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DUX4L9Q6RFH8 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
DUX4L9Q6RFH8 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DUX4L9Q6RFH8 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DUX4L9Q6RFH8 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
DUX4L9Q6RFH8 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DUX4L9Q6RFH8 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
DUX4L9Q6RFH8 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
DUX4L9Q6RFH8 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DUX4L9Q6RFH8 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DUX4L9Q6RFH8 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DUX4L9Q6RFH8 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DUX4L9Q6RFH8 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DUX4L9Q6RFH8 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DUX4L9Q6RFH8 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DUX4L9Q6RFH8 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
DUX4L9Q6RFH8 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
DUX4L9Q6RFH8 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
DUX4L9Q6RFH8 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
DUX4L9Q6RFH8 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DUX4L9Q6RFH8 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DUX4L9Q6RFH8 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
DUX4L9Q6RFH8 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DUX4L9Q6RFH8 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
DUX4L9Q6RFH8 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DUX4L9Q6RFH8 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DUX4L9Q6RFH8 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DUX4L9Q6RFH8 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DUX4L9Q6RFH8 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DUX4L9Q6RFH8 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DUX4L9Q6RFH8 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DUX4L9Q6RFH8 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
DUX4L9Q6RFH8 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms