Protein–RNA interactions for Protein: Q6R2W3

ZBED9, SCAN domain-containing protein 3, humanhuman

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Length 1,325 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED9Q6R2W3 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
ZBED9Q6R2W3 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
ZBED9Q6R2W3 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
ZBED9Q6R2W3 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
ZBED9Q6R2W3 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
ZBED9Q6R2W3 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
ZBED9Q6R2W3 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
ZBED9Q6R2W3 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
ZBED9Q6R2W3 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
ZBED9Q6R2W3 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
ZBED9Q6R2W3 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
ZBED9Q6R2W3 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
ZBED9Q6R2W3 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
ZBED9Q6R2W3 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
ZBED9Q6R2W3 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
ZBED9Q6R2W3 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
ZBED9Q6R2W3 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
ZBED9Q6R2W3 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
ZBED9Q6R2W3 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
ZBED9Q6R2W3 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
ZBED9Q6R2W3 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
ZBED9Q6R2W3 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
ZBED9Q6R2W3 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
ZBED9Q6R2W3 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
ZBED9Q6R2W3 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
ZBED9Q6R2W3 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
ZBED9Q6R2W3 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
ZBED9Q6R2W3 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
ZBED9Q6R2W3 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
ZBED9Q6R2W3 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
ZBED9Q6R2W3 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
ZBED9Q6R2W3 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
ZBED9Q6R2W3 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC28.66■■■□□ 2.18
ZBED9Q6R2W3 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
ZBED9Q6R2W3 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
ZBED9Q6R2W3 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
ZBED9Q6R2W3 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
ZBED9Q6R2W3 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
ZBED9Q6R2W3 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
ZBED9Q6R2W3 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
ZBED9Q6R2W3 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
ZBED9Q6R2W3 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
ZBED9Q6R2W3 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
ZBED9Q6R2W3 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
ZBED9Q6R2W3 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
ZBED9Q6R2W3 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
ZBED9Q6R2W3 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
ZBED9Q6R2W3 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
ZBED9Q6R2W3 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
ZBED9Q6R2W3 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
ZBED9Q6R2W3 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
ZBED9Q6R2W3 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
ZBED9Q6R2W3 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
ZBED9Q6R2W3 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
ZBED9Q6R2W3 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
ZBED9Q6R2W3 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.17
ZBED9Q6R2W3 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
ZBED9Q6R2W3 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
ZBED9Q6R2W3 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
ZBED9Q6R2W3 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
ZBED9Q6R2W3 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
ZBED9Q6R2W3 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
ZBED9Q6R2W3 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
ZBED9Q6R2W3 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
ZBED9Q6R2W3 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
ZBED9Q6R2W3 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
ZBED9Q6R2W3 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
ZBED9Q6R2W3 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
ZBED9Q6R2W3 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
ZBED9Q6R2W3 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
ZBED9Q6R2W3 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
ZBED9Q6R2W3 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
ZBED9Q6R2W3 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
ZBED9Q6R2W3 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
ZBED9Q6R2W3 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
ZBED9Q6R2W3 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
ZBED9Q6R2W3 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
ZBED9Q6R2W3 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
ZBED9Q6R2W3 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
ZBED9Q6R2W3 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
ZBED9Q6R2W3 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
ZBED9Q6R2W3 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
ZBED9Q6R2W3 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
ZBED9Q6R2W3 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
ZBED9Q6R2W3 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
ZBED9Q6R2W3 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
ZBED9Q6R2W3 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
ZBED9Q6R2W3 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
ZBED9Q6R2W3 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
ZBED9Q6R2W3 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
ZBED9Q6R2W3 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
ZBED9Q6R2W3 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
ZBED9Q6R2W3 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
ZBED9Q6R2W3 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
ZBED9Q6R2W3 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
ZBED9Q6R2W3 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
ZBED9Q6R2W3 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC28.59■■■□□ 2.17
ZBED9Q6R2W3 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC28.59■■■□□ 2.17
ZBED9Q6R2W3 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
ZBED9Q6R2W3 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
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