Protein–RNA interactions for Protein: Q6PF15

KLHL35, Kelch-like protein 35, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL35Q6PF15 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KLHL35Q6PF15 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
KLHL35Q6PF15 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KLHL35Q6PF15 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KLHL35Q6PF15 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
KLHL35Q6PF15 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC21.28■■□□□ 1
KLHL35Q6PF15 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KLHL35Q6PF15 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KLHL35Q6PF15 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
KLHL35Q6PF15 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KLHL35Q6PF15 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KLHL35Q6PF15 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KLHL35Q6PF15 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KLHL35Q6PF15 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
KLHL35Q6PF15 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
KLHL35Q6PF15 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KLHL35Q6PF15 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KLHL35Q6PF15 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KLHL35Q6PF15 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
KLHL35Q6PF15 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KLHL35Q6PF15 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
KLHL35Q6PF15 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KLHL35Q6PF15 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KLHL35Q6PF15 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
KLHL35Q6PF15 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KLHL35Q6PF15 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KLHL35Q6PF15 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
KLHL35Q6PF15 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
KLHL35Q6PF15 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
KLHL35Q6PF15 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
KLHL35Q6PF15 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
KLHL35Q6PF15 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
KLHL35Q6PF15 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
KLHL35Q6PF15 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
KLHL35Q6PF15 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KLHL35Q6PF15 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
KLHL35Q6PF15 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
KLHL35Q6PF15 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
KLHL35Q6PF15 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
KLHL35Q6PF15 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
KLHL35Q6PF15 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
KLHL35Q6PF15 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
KLHL35Q6PF15 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
KLHL35Q6PF15 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
KLHL35Q6PF15 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
KLHL35Q6PF15 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
KLHL35Q6PF15 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
KLHL35Q6PF15 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
KLHL35Q6PF15 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
KLHL35Q6PF15 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
KLHL35Q6PF15 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
KLHL35Q6PF15 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
KLHL35Q6PF15 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
KLHL35Q6PF15 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
KLHL35Q6PF15 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
KLHL35Q6PF15 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
KLHL35Q6PF15 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
KLHL35Q6PF15 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
KLHL35Q6PF15 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
KLHL35Q6PF15 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
KLHL35Q6PF15 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
KLHL35Q6PF15 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
KLHL35Q6PF15 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
KLHL35Q6PF15 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
KLHL35Q6PF15 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
KLHL35Q6PF15 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
KLHL35Q6PF15 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
KLHL35Q6PF15 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
KLHL35Q6PF15 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
KLHL35Q6PF15 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
KLHL35Q6PF15 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
KLHL35Q6PF15 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
KLHL35Q6PF15 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
KLHL35Q6PF15 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
KLHL35Q6PF15 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
KLHL35Q6PF15 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
KLHL35Q6PF15 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
KLHL35Q6PF15 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
KLHL35Q6PF15 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
KLHL35Q6PF15 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
KLHL35Q6PF15 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
KLHL35Q6PF15 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
KLHL35Q6PF15 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
KLHL35Q6PF15 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
KLHL35Q6PF15 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
KLHL35Q6PF15 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
KLHL35Q6PF15 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
KLHL35Q6PF15 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
KLHL35Q6PF15 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
KLHL35Q6PF15 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
KLHL35Q6PF15 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
KLHL35Q6PF15 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
KLHL35Q6PF15 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
KLHL35Q6PF15 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
KLHL35Q6PF15 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
KLHL35Q6PF15 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
KLHL35Q6PF15 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
KLHL35Q6PF15 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
KLHL35Q6PF15 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
KLHL35Q6PF15 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms