Protein–RNA interactions for Protein: Q6P4Q7

CNNM4, Metal transporter CNNM4, humanhuman

Predictions only

Length 775 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNNM4Q6P4Q7 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CNNM4Q6P4Q7 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CNNM4Q6P4Q7 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CNNM4Q6P4Q7 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CNNM4Q6P4Q7 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CNNM4Q6P4Q7 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CNNM4Q6P4Q7 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CNNM4Q6P4Q7 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CNNM4Q6P4Q7 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CNNM4Q6P4Q7 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CNNM4Q6P4Q7 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CNNM4Q6P4Q7 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CNNM4Q6P4Q7 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CNNM4Q6P4Q7 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CNNM4Q6P4Q7 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CNNM4Q6P4Q7 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CNNM4Q6P4Q7 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CNNM4Q6P4Q7 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CNNM4Q6P4Q7 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CNNM4Q6P4Q7 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CNNM4Q6P4Q7 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CNNM4Q6P4Q7 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CNNM4Q6P4Q7 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CNNM4Q6P4Q7 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CNNM4Q6P4Q7 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CNNM4Q6P4Q7 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CNNM4Q6P4Q7 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CNNM4Q6P4Q7 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CNNM4Q6P4Q7 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CNNM4Q6P4Q7 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CNNM4Q6P4Q7 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CNNM4Q6P4Q7 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CNNM4Q6P4Q7 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CNNM4Q6P4Q7 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CNNM4Q6P4Q7 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CNNM4Q6P4Q7 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CNNM4Q6P4Q7 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CNNM4Q6P4Q7 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CNNM4Q6P4Q7 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CNNM4Q6P4Q7 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CNNM4Q6P4Q7 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CNNM4Q6P4Q7 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CNNM4Q6P4Q7 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
CNNM4Q6P4Q7 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CNNM4Q6P4Q7 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CNNM4Q6P4Q7 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
CNNM4Q6P4Q7 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CNNM4Q6P4Q7 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CNNM4Q6P4Q7 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CNNM4Q6P4Q7 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CNNM4Q6P4Q7 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CNNM4Q6P4Q7 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CNNM4Q6P4Q7 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CNNM4Q6P4Q7 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CNNM4Q6P4Q7 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CNNM4Q6P4Q7 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CNNM4Q6P4Q7 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CNNM4Q6P4Q7 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CNNM4Q6P4Q7 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CNNM4Q6P4Q7 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CNNM4Q6P4Q7 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CNNM4Q6P4Q7 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CNNM4Q6P4Q7 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CNNM4Q6P4Q7 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CNNM4Q6P4Q7 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CNNM4Q6P4Q7 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CNNM4Q6P4Q7 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CNNM4Q6P4Q7 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CNNM4Q6P4Q7 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CNNM4Q6P4Q7 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CNNM4Q6P4Q7 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CNNM4Q6P4Q7 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CNNM4Q6P4Q7 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CNNM4Q6P4Q7 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CNNM4Q6P4Q7 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CNNM4Q6P4Q7 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CNNM4Q6P4Q7 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CNNM4Q6P4Q7 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CNNM4Q6P4Q7 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CNNM4Q6P4Q7 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CNNM4Q6P4Q7 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CNNM4Q6P4Q7 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CNNM4Q6P4Q7 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CNNM4Q6P4Q7 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CNNM4Q6P4Q7 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CNNM4Q6P4Q7 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CNNM4Q6P4Q7 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CNNM4Q6P4Q7 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CNNM4Q6P4Q7 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CNNM4Q6P4Q7 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CNNM4Q6P4Q7 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CNNM4Q6P4Q7 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CNNM4Q6P4Q7 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CNNM4Q6P4Q7 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CNNM4Q6P4Q7 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CNNM4Q6P4Q7 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CNNM4Q6P4Q7 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CNNM4Q6P4Q7 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CNNM4Q6P4Q7 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CNNM4Q6P4Q7 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms