Protein–RNA interactions for Protein: Q6NW29

RWDD4, RWD domain-containing protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RWDD4Q6NW29 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RWDD4Q6NW29 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RWDD4Q6NW29 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RWDD4Q6NW29 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RWDD4Q6NW29 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RWDD4Q6NW29 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RWDD4Q6NW29 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
RWDD4Q6NW29 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
RWDD4Q6NW29 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RWDD4Q6NW29 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
RWDD4Q6NW29 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RWDD4Q6NW29 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
RWDD4Q6NW29 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RWDD4Q6NW29 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RWDD4Q6NW29 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RWDD4Q6NW29 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RWDD4Q6NW29 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RWDD4Q6NW29 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
RWDD4Q6NW29 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RWDD4Q6NW29 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RWDD4Q6NW29 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RWDD4Q6NW29 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RWDD4Q6NW29 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RWDD4Q6NW29 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RWDD4Q6NW29 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RWDD4Q6NW29 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RWDD4Q6NW29 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RWDD4Q6NW29 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RWDD4Q6NW29 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RWDD4Q6NW29 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RWDD4Q6NW29 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RWDD4Q6NW29 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RWDD4Q6NW29 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RWDD4Q6NW29 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RWDD4Q6NW29 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RWDD4Q6NW29 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RWDD4Q6NW29 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RWDD4Q6NW29 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RWDD4Q6NW29 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RWDD4Q6NW29 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
RWDD4Q6NW29 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
RWDD4Q6NW29 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RWDD4Q6NW29 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RWDD4Q6NW29 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RWDD4Q6NW29 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RWDD4Q6NW29 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RWDD4Q6NW29 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RWDD4Q6NW29 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
RWDD4Q6NW29 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RWDD4Q6NW29 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RWDD4Q6NW29 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RWDD4Q6NW29 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RWDD4Q6NW29 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RWDD4Q6NW29 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RWDD4Q6NW29 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RWDD4Q6NW29 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RWDD4Q6NW29 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RWDD4Q6NW29 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RWDD4Q6NW29 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RWDD4Q6NW29 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RWDD4Q6NW29 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RWDD4Q6NW29 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RWDD4Q6NW29 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RWDD4Q6NW29 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RWDD4Q6NW29 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RWDD4Q6NW29 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RWDD4Q6NW29 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RWDD4Q6NW29 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
RWDD4Q6NW29 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RWDD4Q6NW29 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RWDD4Q6NW29 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RWDD4Q6NW29 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RWDD4Q6NW29 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RWDD4Q6NW29 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RWDD4Q6NW29 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RWDD4Q6NW29 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
RWDD4Q6NW29 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RWDD4Q6NW29 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RWDD4Q6NW29 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RWDD4Q6NW29 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RWDD4Q6NW29 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RWDD4Q6NW29 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RWDD4Q6NW29 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RWDD4Q6NW29 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RWDD4Q6NW29 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RWDD4Q6NW29 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RWDD4Q6NW29 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RWDD4Q6NW29 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RWDD4Q6NW29 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RWDD4Q6NW29 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RWDD4Q6NW29 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RWDD4Q6NW29 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RWDD4Q6NW29 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RWDD4Q6NW29 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RWDD4Q6NW29 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RWDD4Q6NW29 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RWDD4Q6NW29 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RWDD4Q6NW29 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RWDD4Q6NW29 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RWDD4Q6NW29 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms