Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSW7

NANOGP8, Putative homeobox protein NANOGP8, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NANOGP8Q6NSW7 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
NANOGP8Q6NSW7 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
NANOGP8Q6NSW7 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
NANOGP8Q6NSW7 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NANOGP8Q6NSW7 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
NANOGP8Q6NSW7 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NANOGP8Q6NSW7 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
NANOGP8Q6NSW7 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NANOGP8Q6NSW7 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
NANOGP8Q6NSW7 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
NANOGP8Q6NSW7 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
NANOGP8Q6NSW7 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NANOGP8Q6NSW7 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NANOGP8Q6NSW7 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
NANOGP8Q6NSW7 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NANOGP8Q6NSW7 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
NANOGP8Q6NSW7 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NANOGP8Q6NSW7 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
NANOGP8Q6NSW7 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
NANOGP8Q6NSW7 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
NANOGP8Q6NSW7 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
NANOGP8Q6NSW7 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
NANOGP8Q6NSW7 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
NANOGP8Q6NSW7 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
NANOGP8Q6NSW7 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
NANOGP8Q6NSW7 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
NANOGP8Q6NSW7 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
NANOGP8Q6NSW7 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
NANOGP8Q6NSW7 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
NANOGP8Q6NSW7 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
NANOGP8Q6NSW7 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
NANOGP8Q6NSW7 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
NANOGP8Q6NSW7 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
NANOGP8Q6NSW7 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
NANOGP8Q6NSW7 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
NANOGP8Q6NSW7 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
NANOGP8Q6NSW7 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NANOGP8Q6NSW7 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NANOGP8Q6NSW7 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
NANOGP8Q6NSW7 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NANOGP8Q6NSW7 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
NANOGP8Q6NSW7 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NANOGP8Q6NSW7 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NANOGP8Q6NSW7 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
NANOGP8Q6NSW7 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NANOGP8Q6NSW7 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NANOGP8Q6NSW7 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NANOGP8Q6NSW7 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NANOGP8Q6NSW7 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
NANOGP8Q6NSW7 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NANOGP8Q6NSW7 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NANOGP8Q6NSW7 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
NANOGP8Q6NSW7 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NANOGP8Q6NSW7 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NANOGP8Q6NSW7 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NANOGP8Q6NSW7 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
NANOGP8Q6NSW7 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
NANOGP8Q6NSW7 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
NANOGP8Q6NSW7 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NANOGP8Q6NSW7 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NANOGP8Q6NSW7 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NANOGP8Q6NSW7 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NANOGP8Q6NSW7 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
NANOGP8Q6NSW7 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NANOGP8Q6NSW7 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NANOGP8Q6NSW7 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
NANOGP8Q6NSW7 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NANOGP8Q6NSW7 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NANOGP8Q6NSW7 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NANOGP8Q6NSW7 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NANOGP8Q6NSW7 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
NANOGP8Q6NSW7 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NANOGP8Q6NSW7 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
NANOGP8Q6NSW7 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
NANOGP8Q6NSW7 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NANOGP8Q6NSW7 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NANOGP8Q6NSW7 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NANOGP8Q6NSW7 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NANOGP8Q6NSW7 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NANOGP8Q6NSW7 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NANOGP8Q6NSW7 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
NANOGP8Q6NSW7 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NANOGP8Q6NSW7 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NANOGP8Q6NSW7 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NANOGP8Q6NSW7 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NANOGP8Q6NSW7 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NANOGP8Q6NSW7 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NANOGP8Q6NSW7 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NANOGP8Q6NSW7 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NANOGP8Q6NSW7 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NANOGP8Q6NSW7 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NANOGP8Q6NSW7 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NANOGP8Q6NSW7 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NANOGP8Q6NSW7 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NANOGP8Q6NSW7 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NANOGP8Q6NSW7 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NANOGP8Q6NSW7 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NANOGP8Q6NSW7 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NANOGP8Q6NSW7 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NANOGP8Q6NSW7 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.6 ms