Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSJ5

LRRC8E, Volume-regulated anion channel subunit LRRC8E, humanhuman

Predictions only

Length 796 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC8EQ6NSJ5 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LRRC8EQ6NSJ5 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LRRC8EQ6NSJ5 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LRRC8EQ6NSJ5 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LRRC8EQ6NSJ5 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LRRC8EQ6NSJ5 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LRRC8EQ6NSJ5 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LRRC8EQ6NSJ5 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LRRC8EQ6NSJ5 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LRRC8EQ6NSJ5 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LRRC8EQ6NSJ5 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LRRC8EQ6NSJ5 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LRRC8EQ6NSJ5 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LRRC8EQ6NSJ5 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LRRC8EQ6NSJ5 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LRRC8EQ6NSJ5 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LRRC8EQ6NSJ5 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LRRC8EQ6NSJ5 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LRRC8EQ6NSJ5 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LRRC8EQ6NSJ5 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LRRC8EQ6NSJ5 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LRRC8EQ6NSJ5 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LRRC8EQ6NSJ5 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LRRC8EQ6NSJ5 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LRRC8EQ6NSJ5 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LRRC8EQ6NSJ5 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LRRC8EQ6NSJ5 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LRRC8EQ6NSJ5 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LRRC8EQ6NSJ5 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
LRRC8EQ6NSJ5 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
LRRC8EQ6NSJ5 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
LRRC8EQ6NSJ5 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
LRRC8EQ6NSJ5 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LRRC8EQ6NSJ5 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LRRC8EQ6NSJ5 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
LRRC8EQ6NSJ5 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LRRC8EQ6NSJ5 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LRRC8EQ6NSJ5 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LRRC8EQ6NSJ5 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LRRC8EQ6NSJ5 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
LRRC8EQ6NSJ5 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LRRC8EQ6NSJ5 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
LRRC8EQ6NSJ5 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LRRC8EQ6NSJ5 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LRRC8EQ6NSJ5 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LRRC8EQ6NSJ5 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LRRC8EQ6NSJ5 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LRRC8EQ6NSJ5 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LRRC8EQ6NSJ5 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LRRC8EQ6NSJ5 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LRRC8EQ6NSJ5 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LRRC8EQ6NSJ5 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LRRC8EQ6NSJ5 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LRRC8EQ6NSJ5 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
LRRC8EQ6NSJ5 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LRRC8EQ6NSJ5 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LRRC8EQ6NSJ5 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LRRC8EQ6NSJ5 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LRRC8EQ6NSJ5 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LRRC8EQ6NSJ5 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LRRC8EQ6NSJ5 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
LRRC8EQ6NSJ5 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
LRRC8EQ6NSJ5 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LRRC8EQ6NSJ5 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
LRRC8EQ6NSJ5 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
LRRC8EQ6NSJ5 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LRRC8EQ6NSJ5 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
LRRC8EQ6NSJ5 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
LRRC8EQ6NSJ5 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
LRRC8EQ6NSJ5 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
LRRC8EQ6NSJ5 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LRRC8EQ6NSJ5 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LRRC8EQ6NSJ5 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LRRC8EQ6NSJ5 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LRRC8EQ6NSJ5 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LRRC8EQ6NSJ5 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LRRC8EQ6NSJ5 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LRRC8EQ6NSJ5 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LRRC8EQ6NSJ5 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LRRC8EQ6NSJ5 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LRRC8EQ6NSJ5 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LRRC8EQ6NSJ5 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LRRC8EQ6NSJ5 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LRRC8EQ6NSJ5 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LRRC8EQ6NSJ5 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LRRC8EQ6NSJ5 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LRRC8EQ6NSJ5 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LRRC8EQ6NSJ5 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LRRC8EQ6NSJ5 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
LRRC8EQ6NSJ5 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
LRRC8EQ6NSJ5 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
LRRC8EQ6NSJ5 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LRRC8EQ6NSJ5 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LRRC8EQ6NSJ5 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LRRC8EQ6NSJ5 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LRRC8EQ6NSJ5 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LRRC8EQ6NSJ5 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LRRC8EQ6NSJ5 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LRRC8EQ6NSJ5 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LRRC8EQ6NSJ5 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms