Protein–RNA interactions for Protein: Q6DN14

MCTP1, Multiple C2 and transmembrane domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 999 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCTP1Q6DN14 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
MCTP1Q6DN14 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
MCTP1Q6DN14 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
MCTP1Q6DN14 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
MCTP1Q6DN14 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
MCTP1Q6DN14 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
MCTP1Q6DN14 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
MCTP1Q6DN14 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
MCTP1Q6DN14 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
MCTP1Q6DN14 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
MCTP1Q6DN14 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
MCTP1Q6DN14 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
MCTP1Q6DN14 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
MCTP1Q6DN14 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
MCTP1Q6DN14 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
MCTP1Q6DN14 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
MCTP1Q6DN14 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
MCTP1Q6DN14 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
MCTP1Q6DN14 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
MCTP1Q6DN14 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
MCTP1Q6DN14 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
MCTP1Q6DN14 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
MCTP1Q6DN14 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
MCTP1Q6DN14 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
MCTP1Q6DN14 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
MCTP1Q6DN14 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
MCTP1Q6DN14 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
MCTP1Q6DN14 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC25.5■■□□□ 1.67
MCTP1Q6DN14 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
MCTP1Q6DN14 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
MCTP1Q6DN14 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
MCTP1Q6DN14 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
MCTP1Q6DN14 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
MCTP1Q6DN14 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
MCTP1Q6DN14 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
MCTP1Q6DN14 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
MCTP1Q6DN14 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
MCTP1Q6DN14 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
MCTP1Q6DN14 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
MCTP1Q6DN14 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
MCTP1Q6DN14 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
MCTP1Q6DN14 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
MCTP1Q6DN14 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
MCTP1Q6DN14 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
MCTP1Q6DN14 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
MCTP1Q6DN14 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
MCTP1Q6DN14 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
MCTP1Q6DN14 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
MCTP1Q6DN14 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
MCTP1Q6DN14 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
MCTP1Q6DN14 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC25.47■■□□□ 1.67
MCTP1Q6DN14 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
MCTP1Q6DN14 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
MCTP1Q6DN14 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
MCTP1Q6DN14 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
MCTP1Q6DN14 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
MCTP1Q6DN14 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
MCTP1Q6DN14 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
MCTP1Q6DN14 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
MCTP1Q6DN14 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
MCTP1Q6DN14 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
MCTP1Q6DN14 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
MCTP1Q6DN14 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
MCTP1Q6DN14 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
MCTP1Q6DN14 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
MCTP1Q6DN14 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
MCTP1Q6DN14 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
MCTP1Q6DN14 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
MCTP1Q6DN14 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
MCTP1Q6DN14 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
MCTP1Q6DN14 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
MCTP1Q6DN14 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
MCTP1Q6DN14 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
MCTP1Q6DN14 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
MCTP1Q6DN14 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
MCTP1Q6DN14 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
MCTP1Q6DN14 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
MCTP1Q6DN14 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
MCTP1Q6DN14 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
MCTP1Q6DN14 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
MCTP1Q6DN14 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
MCTP1Q6DN14 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
MCTP1Q6DN14 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
MCTP1Q6DN14 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
MCTP1Q6DN14 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
MCTP1Q6DN14 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
MCTP1Q6DN14 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
MCTP1Q6DN14 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
MCTP1Q6DN14 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
MCTP1Q6DN14 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
MCTP1Q6DN14 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
MCTP1Q6DN14 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
MCTP1Q6DN14 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
MCTP1Q6DN14 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
MCTP1Q6DN14 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
MCTP1Q6DN14 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
MCTP1Q6DN14 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
MCTP1Q6DN14 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
MCTP1Q6DN14 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
MCTP1Q6DN14 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms