Protein–RNA interactions for Protein: Q5VZM2

RRAGB, Ras-related GTP-binding protein B, humanhuman

Predictions only

Length 374 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRAGBQ5VZM2 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RRAGBQ5VZM2 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RRAGBQ5VZM2 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RRAGBQ5VZM2 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RRAGBQ5VZM2 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RRAGBQ5VZM2 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RRAGBQ5VZM2 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RRAGBQ5VZM2 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RRAGBQ5VZM2 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RRAGBQ5VZM2 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RRAGBQ5VZM2 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RRAGBQ5VZM2 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RRAGBQ5VZM2 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RRAGBQ5VZM2 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RRAGBQ5VZM2 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RRAGBQ5VZM2 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RRAGBQ5VZM2 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RRAGBQ5VZM2 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RRAGBQ5VZM2 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RRAGBQ5VZM2 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RRAGBQ5VZM2 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RRAGBQ5VZM2 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RRAGBQ5VZM2 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RRAGBQ5VZM2 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RRAGBQ5VZM2 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RRAGBQ5VZM2 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RRAGBQ5VZM2 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RRAGBQ5VZM2 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RRAGBQ5VZM2 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RRAGBQ5VZM2 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RRAGBQ5VZM2 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
RRAGBQ5VZM2 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RRAGBQ5VZM2 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
RRAGBQ5VZM2 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RRAGBQ5VZM2 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RRAGBQ5VZM2 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RRAGBQ5VZM2 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RRAGBQ5VZM2 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RRAGBQ5VZM2 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RRAGBQ5VZM2 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RRAGBQ5VZM2 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RRAGBQ5VZM2 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RRAGBQ5VZM2 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RRAGBQ5VZM2 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RRAGBQ5VZM2 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RRAGBQ5VZM2 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RRAGBQ5VZM2 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RRAGBQ5VZM2 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RRAGBQ5VZM2 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RRAGBQ5VZM2 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RRAGBQ5VZM2 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RRAGBQ5VZM2 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RRAGBQ5VZM2 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RRAGBQ5VZM2 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
RRAGBQ5VZM2 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
RRAGBQ5VZM2 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RRAGBQ5VZM2 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RRAGBQ5VZM2 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RRAGBQ5VZM2 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
RRAGBQ5VZM2 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RRAGBQ5VZM2 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RRAGBQ5VZM2 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RRAGBQ5VZM2 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RRAGBQ5VZM2 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RRAGBQ5VZM2 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RRAGBQ5VZM2 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RRAGBQ5VZM2 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RRAGBQ5VZM2 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
RRAGBQ5VZM2 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RRAGBQ5VZM2 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RRAGBQ5VZM2 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RRAGBQ5VZM2 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RRAGBQ5VZM2 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RRAGBQ5VZM2 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RRAGBQ5VZM2 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RRAGBQ5VZM2 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
RRAGBQ5VZM2 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RRAGBQ5VZM2 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
RRAGBQ5VZM2 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RRAGBQ5VZM2 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RRAGBQ5VZM2 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RRAGBQ5VZM2 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RRAGBQ5VZM2 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RRAGBQ5VZM2 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RRAGBQ5VZM2 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RRAGBQ5VZM2 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RRAGBQ5VZM2 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RRAGBQ5VZM2 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RRAGBQ5VZM2 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RRAGBQ5VZM2 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RRAGBQ5VZM2 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RRAGBQ5VZM2 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
RRAGBQ5VZM2 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
RRAGBQ5VZM2 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RRAGBQ5VZM2 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RRAGBQ5VZM2 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RRAGBQ5VZM2 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RRAGBQ5VZM2 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RRAGBQ5VZM2 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RRAGBQ5VZM2 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms