Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWP2

FAM46C, Putative nucleotidyltransferase FAM46C, humanhuman

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Length 391 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM46CQ5VWP2 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
FAM46CQ5VWP2 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC21.78■■□□□ 1.08
FAM46CQ5VWP2 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
FAM46CQ5VWP2 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
FAM46CQ5VWP2 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
FAM46CQ5VWP2 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
FAM46CQ5VWP2 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
FAM46CQ5VWP2 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
FAM46CQ5VWP2 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
FAM46CQ5VWP2 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
FAM46CQ5VWP2 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
FAM46CQ5VWP2 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
FAM46CQ5VWP2 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
FAM46CQ5VWP2 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
FAM46CQ5VWP2 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
FAM46CQ5VWP2 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
FAM46CQ5VWP2 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
FAM46CQ5VWP2 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
FAM46CQ5VWP2 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
FAM46CQ5VWP2 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC21.77■■□□□ 1.07
FAM46CQ5VWP2 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
FAM46CQ5VWP2 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
FAM46CQ5VWP2 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
FAM46CQ5VWP2 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
FAM46CQ5VWP2 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
FAM46CQ5VWP2 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
FAM46CQ5VWP2 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
FAM46CQ5VWP2 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
FAM46CQ5VWP2 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
FAM46CQ5VWP2 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FAM46CQ5VWP2 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FAM46CQ5VWP2 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FAM46CQ5VWP2 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FAM46CQ5VWP2 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
FAM46CQ5VWP2 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
FAM46CQ5VWP2 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
FAM46CQ5VWP2 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
FAM46CQ5VWP2 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FAM46CQ5VWP2 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
FAM46CQ5VWP2 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FAM46CQ5VWP2 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FAM46CQ5VWP2 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FAM46CQ5VWP2 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
FAM46CQ5VWP2 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FAM46CQ5VWP2 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
FAM46CQ5VWP2 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
FAM46CQ5VWP2 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
FAM46CQ5VWP2 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
FAM46CQ5VWP2 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
FAM46CQ5VWP2 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
FAM46CQ5VWP2 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
FAM46CQ5VWP2 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
FAM46CQ5VWP2 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
FAM46CQ5VWP2 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
FAM46CQ5VWP2 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
FAM46CQ5VWP2 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
FAM46CQ5VWP2 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
FAM46CQ5VWP2 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
FAM46CQ5VWP2 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
FAM46CQ5VWP2 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
FAM46CQ5VWP2 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
FAM46CQ5VWP2 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
FAM46CQ5VWP2 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FAM46CQ5VWP2 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FAM46CQ5VWP2 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FAM46CQ5VWP2 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
FAM46CQ5VWP2 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FAM46CQ5VWP2 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FAM46CQ5VWP2 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
FAM46CQ5VWP2 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
FAM46CQ5VWP2 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
FAM46CQ5VWP2 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
FAM46CQ5VWP2 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
FAM46CQ5VWP2 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FAM46CQ5VWP2 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FAM46CQ5VWP2 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
FAM46CQ5VWP2 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
FAM46CQ5VWP2 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
FAM46CQ5VWP2 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FAM46CQ5VWP2 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
FAM46CQ5VWP2 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
FAM46CQ5VWP2 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FAM46CQ5VWP2 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FAM46CQ5VWP2 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
FAM46CQ5VWP2 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
FAM46CQ5VWP2 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FAM46CQ5VWP2 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
FAM46CQ5VWP2 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FAM46CQ5VWP2 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
FAM46CQ5VWP2 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FAM46CQ5VWP2 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FAM46CQ5VWP2 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
FAM46CQ5VWP2 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FAM46CQ5VWP2 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
FAM46CQ5VWP2 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FAM46CQ5VWP2 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FAM46CQ5VWP2 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FAM46CQ5VWP2 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
FAM46CQ5VWP2 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
FAM46CQ5VWP2 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
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