Protein–RNA interactions for Protein: Q5VSY0

GKAP1, G kinase-anchoring protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 366 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GKAP1Q5VSY0 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GKAP1Q5VSY0 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GKAP1Q5VSY0 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GKAP1Q5VSY0 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GKAP1Q5VSY0 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GKAP1Q5VSY0 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GKAP1Q5VSY0 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GKAP1Q5VSY0 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GKAP1Q5VSY0 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GKAP1Q5VSY0 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
GKAP1Q5VSY0 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GKAP1Q5VSY0 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GKAP1Q5VSY0 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
GKAP1Q5VSY0 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GKAP1Q5VSY0 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GKAP1Q5VSY0 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
GKAP1Q5VSY0 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
GKAP1Q5VSY0 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GKAP1Q5VSY0 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
GKAP1Q5VSY0 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GKAP1Q5VSY0 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GKAP1Q5VSY0 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GKAP1Q5VSY0 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GKAP1Q5VSY0 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GKAP1Q5VSY0 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GKAP1Q5VSY0 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GKAP1Q5VSY0 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GKAP1Q5VSY0 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GKAP1Q5VSY0 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GKAP1Q5VSY0 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GKAP1Q5VSY0 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GKAP1Q5VSY0 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GKAP1Q5VSY0 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GKAP1Q5VSY0 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GKAP1Q5VSY0 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GKAP1Q5VSY0 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
GKAP1Q5VSY0 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GKAP1Q5VSY0 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GKAP1Q5VSY0 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GKAP1Q5VSY0 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GKAP1Q5VSY0 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GKAP1Q5VSY0 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GKAP1Q5VSY0 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GKAP1Q5VSY0 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GKAP1Q5VSY0 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GKAP1Q5VSY0 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GKAP1Q5VSY0 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GKAP1Q5VSY0 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GKAP1Q5VSY0 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GKAP1Q5VSY0 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GKAP1Q5VSY0 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GKAP1Q5VSY0 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GKAP1Q5VSY0 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GKAP1Q5VSY0 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GKAP1Q5VSY0 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GKAP1Q5VSY0 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GKAP1Q5VSY0 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
GKAP1Q5VSY0 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GKAP1Q5VSY0 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GKAP1Q5VSY0 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GKAP1Q5VSY0 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GKAP1Q5VSY0 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GKAP1Q5VSY0 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GKAP1Q5VSY0 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GKAP1Q5VSY0 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GKAP1Q5VSY0 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GKAP1Q5VSY0 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GKAP1Q5VSY0 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GKAP1Q5VSY0 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GKAP1Q5VSY0 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GKAP1Q5VSY0 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GKAP1Q5VSY0 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GKAP1Q5VSY0 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GKAP1Q5VSY0 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GKAP1Q5VSY0 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GKAP1Q5VSY0 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GKAP1Q5VSY0 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GKAP1Q5VSY0 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
GKAP1Q5VSY0 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GKAP1Q5VSY0 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GKAP1Q5VSY0 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GKAP1Q5VSY0 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GKAP1Q5VSY0 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GKAP1Q5VSY0 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GKAP1Q5VSY0 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GKAP1Q5VSY0 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GKAP1Q5VSY0 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GKAP1Q5VSY0 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GKAP1Q5VSY0 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
GKAP1Q5VSY0 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GKAP1Q5VSY0 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GKAP1Q5VSY0 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GKAP1Q5VSY0 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GKAP1Q5VSY0 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GKAP1Q5VSY0 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
GKAP1Q5VSY0 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
GKAP1Q5VSY0 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
GKAP1Q5VSY0 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
GKAP1Q5VSY0 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
GKAP1Q5VSY0 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
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