Protein–RNA interactions for Protein: Q5VSL9

STRIP1, Striatin-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRIP1Q5VSL9 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
STRIP1Q5VSL9 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
STRIP1Q5VSL9 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
STRIP1Q5VSL9 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
STRIP1Q5VSL9 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
STRIP1Q5VSL9 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
STRIP1Q5VSL9 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
STRIP1Q5VSL9 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
STRIP1Q5VSL9 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
STRIP1Q5VSL9 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
STRIP1Q5VSL9 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
STRIP1Q5VSL9 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
STRIP1Q5VSL9 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
STRIP1Q5VSL9 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
STRIP1Q5VSL9 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
STRIP1Q5VSL9 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
STRIP1Q5VSL9 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
STRIP1Q5VSL9 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
STRIP1Q5VSL9 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
STRIP1Q5VSL9 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
STRIP1Q5VSL9 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
STRIP1Q5VSL9 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
STRIP1Q5VSL9 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
STRIP1Q5VSL9 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
STRIP1Q5VSL9 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
STRIP1Q5VSL9 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
STRIP1Q5VSL9 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
STRIP1Q5VSL9 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
STRIP1Q5VSL9 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
STRIP1Q5VSL9 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
STRIP1Q5VSL9 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
STRIP1Q5VSL9 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
STRIP1Q5VSL9 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
STRIP1Q5VSL9 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
STRIP1Q5VSL9 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
STRIP1Q5VSL9 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
STRIP1Q5VSL9 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
STRIP1Q5VSL9 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
STRIP1Q5VSL9 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
STRIP1Q5VSL9 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
STRIP1Q5VSL9 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
STRIP1Q5VSL9 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
STRIP1Q5VSL9 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
STRIP1Q5VSL9 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
STRIP1Q5VSL9 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
STRIP1Q5VSL9 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
STRIP1Q5VSL9 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
STRIP1Q5VSL9 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
STRIP1Q5VSL9 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
STRIP1Q5VSL9 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
STRIP1Q5VSL9 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
STRIP1Q5VSL9 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
STRIP1Q5VSL9 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
STRIP1Q5VSL9 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
STRIP1Q5VSL9 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
STRIP1Q5VSL9 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
STRIP1Q5VSL9 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
STRIP1Q5VSL9 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
STRIP1Q5VSL9 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
STRIP1Q5VSL9 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
STRIP1Q5VSL9 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
STRIP1Q5VSL9 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
STRIP1Q5VSL9 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
STRIP1Q5VSL9 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
STRIP1Q5VSL9 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
STRIP1Q5VSL9 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
STRIP1Q5VSL9 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
STRIP1Q5VSL9 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
STRIP1Q5VSL9 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
STRIP1Q5VSL9 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
STRIP1Q5VSL9 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
STRIP1Q5VSL9 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
STRIP1Q5VSL9 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
STRIP1Q5VSL9 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
STRIP1Q5VSL9 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
STRIP1Q5VSL9 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
STRIP1Q5VSL9 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
STRIP1Q5VSL9 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
STRIP1Q5VSL9 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
STRIP1Q5VSL9 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
STRIP1Q5VSL9 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
STRIP1Q5VSL9 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
STRIP1Q5VSL9 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
STRIP1Q5VSL9 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
STRIP1Q5VSL9 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC26.16■■□□□ 1.78
STRIP1Q5VSL9 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
STRIP1Q5VSL9 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
STRIP1Q5VSL9 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
STRIP1Q5VSL9 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
STRIP1Q5VSL9 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.16■■□□□ 1.78
STRIP1Q5VSL9 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
STRIP1Q5VSL9 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
STRIP1Q5VSL9 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
STRIP1Q5VSL9 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
STRIP1Q5VSL9 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
STRIP1Q5VSL9 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
STRIP1Q5VSL9 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
STRIP1Q5VSL9 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
STRIP1Q5VSL9 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
STRIP1Q5VSL9 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.6 ms