Protein–RNA interactions for Protein: Q5T5X7

BEND3, BEN domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEND3Q5T5X7 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC27.33■■□□□ 1.97
BEND3Q5T5X7 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
BEND3Q5T5X7 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
BEND3Q5T5X7 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
BEND3Q5T5X7 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
BEND3Q5T5X7 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
BEND3Q5T5X7 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
BEND3Q5T5X7 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
BEND3Q5T5X7 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
BEND3Q5T5X7 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC27.32■■□□□ 1.96
BEND3Q5T5X7 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
BEND3Q5T5X7 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
BEND3Q5T5X7 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
BEND3Q5T5X7 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
BEND3Q5T5X7 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
BEND3Q5T5X7 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
BEND3Q5T5X7 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
BEND3Q5T5X7 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
BEND3Q5T5X7 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
BEND3Q5T5X7 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC27.31■■□□□ 1.96
BEND3Q5T5X7 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
BEND3Q5T5X7 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
BEND3Q5T5X7 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
BEND3Q5T5X7 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
BEND3Q5T5X7 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
BEND3Q5T5X7 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
BEND3Q5T5X7 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
BEND3Q5T5X7 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
BEND3Q5T5X7 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC27.3■■□□□ 1.96
BEND3Q5T5X7 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
BEND3Q5T5X7 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
BEND3Q5T5X7 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
BEND3Q5T5X7 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
BEND3Q5T5X7 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
BEND3Q5T5X7 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
BEND3Q5T5X7 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
BEND3Q5T5X7 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
BEND3Q5T5X7 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
BEND3Q5T5X7 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
BEND3Q5T5X7 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
BEND3Q5T5X7 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
BEND3Q5T5X7 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
BEND3Q5T5X7 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
BEND3Q5T5X7 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
BEND3Q5T5X7 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
BEND3Q5T5X7 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
BEND3Q5T5X7 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
BEND3Q5T5X7 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
BEND3Q5T5X7 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
BEND3Q5T5X7 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
BEND3Q5T5X7 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
BEND3Q5T5X7 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
BEND3Q5T5X7 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
BEND3Q5T5X7 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
BEND3Q5T5X7 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
BEND3Q5T5X7 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
BEND3Q5T5X7 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
BEND3Q5T5X7 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
BEND3Q5T5X7 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
BEND3Q5T5X7 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
BEND3Q5T5X7 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
BEND3Q5T5X7 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
BEND3Q5T5X7 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
BEND3Q5T5X7 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
BEND3Q5T5X7 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
BEND3Q5T5X7 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
BEND3Q5T5X7 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC27.27■■□□□ 1.96
BEND3Q5T5X7 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC27.27■■□□□ 1.96
BEND3Q5T5X7 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
BEND3Q5T5X7 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
BEND3Q5T5X7 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
BEND3Q5T5X7 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
BEND3Q5T5X7 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
BEND3Q5T5X7 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
BEND3Q5T5X7 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
BEND3Q5T5X7 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
BEND3Q5T5X7 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
BEND3Q5T5X7 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC27.27■■□□□ 1.96
BEND3Q5T5X7 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
BEND3Q5T5X7 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
BEND3Q5T5X7 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
BEND3Q5T5X7 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
BEND3Q5T5X7 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
BEND3Q5T5X7 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
BEND3Q5T5X7 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
BEND3Q5T5X7 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
BEND3Q5T5X7 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
BEND3Q5T5X7 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
BEND3Q5T5X7 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.95
BEND3Q5T5X7 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
BEND3Q5T5X7 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
BEND3Q5T5X7 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
BEND3Q5T5X7 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
BEND3Q5T5X7 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.95
BEND3Q5T5X7 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
BEND3Q5T5X7 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
BEND3Q5T5X7 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
BEND3Q5T5X7 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
BEND3Q5T5X7 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
BEND3Q5T5X7 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms