Protein–RNA interactions for Protein: Q5SQQ9

VAX1, Ventral anterior homeobox 1, humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAX1Q5SQQ9 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
VAX1Q5SQQ9 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
VAX1Q5SQQ9 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
VAX1Q5SQQ9 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
VAX1Q5SQQ9 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VAX1Q5SQQ9 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VAX1Q5SQQ9 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VAX1Q5SQQ9 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
VAX1Q5SQQ9 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
VAX1Q5SQQ9 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
VAX1Q5SQQ9 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
VAX1Q5SQQ9 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
VAX1Q5SQQ9 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
VAX1Q5SQQ9 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
VAX1Q5SQQ9 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
VAX1Q5SQQ9 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
VAX1Q5SQQ9 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
VAX1Q5SQQ9 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
VAX1Q5SQQ9 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
VAX1Q5SQQ9 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
VAX1Q5SQQ9 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
VAX1Q5SQQ9 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
VAX1Q5SQQ9 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
VAX1Q5SQQ9 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
VAX1Q5SQQ9 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
VAX1Q5SQQ9 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
VAX1Q5SQQ9 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
VAX1Q5SQQ9 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
VAX1Q5SQQ9 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
VAX1Q5SQQ9 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
VAX1Q5SQQ9 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC18.21■□□□□ 0.5
VAX1Q5SQQ9 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
VAX1Q5SQQ9 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
VAX1Q5SQQ9 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
VAX1Q5SQQ9 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
VAX1Q5SQQ9 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
VAX1Q5SQQ9 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
VAX1Q5SQQ9 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
VAX1Q5SQQ9 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
VAX1Q5SQQ9 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
VAX1Q5SQQ9 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
VAX1Q5SQQ9 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
VAX1Q5SQQ9 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
VAX1Q5SQQ9 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
VAX1Q5SQQ9 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
VAX1Q5SQQ9 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
VAX1Q5SQQ9 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
VAX1Q5SQQ9 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
VAX1Q5SQQ9 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
VAX1Q5SQQ9 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
VAX1Q5SQQ9 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
VAX1Q5SQQ9 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
VAX1Q5SQQ9 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
VAX1Q5SQQ9 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
VAX1Q5SQQ9 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
VAX1Q5SQQ9 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
VAX1Q5SQQ9 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
VAX1Q5SQQ9 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
VAX1Q5SQQ9 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
VAX1Q5SQQ9 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
VAX1Q5SQQ9 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
VAX1Q5SQQ9 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
VAX1Q5SQQ9 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
VAX1Q5SQQ9 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
VAX1Q5SQQ9 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
VAX1Q5SQQ9 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
VAX1Q5SQQ9 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
VAX1Q5SQQ9 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
VAX1Q5SQQ9 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
VAX1Q5SQQ9 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
VAX1Q5SQQ9 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
VAX1Q5SQQ9 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
VAX1Q5SQQ9 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
VAX1Q5SQQ9 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
VAX1Q5SQQ9 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
VAX1Q5SQQ9 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
VAX1Q5SQQ9 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
VAX1Q5SQQ9 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
VAX1Q5SQQ9 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
VAX1Q5SQQ9 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
VAX1Q5SQQ9 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
VAX1Q5SQQ9 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
VAX1Q5SQQ9 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
VAX1Q5SQQ9 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
VAX1Q5SQQ9 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
VAX1Q5SQQ9 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
VAX1Q5SQQ9 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
VAX1Q5SQQ9 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
VAX1Q5SQQ9 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
VAX1Q5SQQ9 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
VAX1Q5SQQ9 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
VAX1Q5SQQ9 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
VAX1Q5SQQ9 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
VAX1Q5SQQ9 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
VAX1Q5SQQ9 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
VAX1Q5SQQ9 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
VAX1Q5SQQ9 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
VAX1Q5SQQ9 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
VAX1Q5SQQ9 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
VAX1Q5SQQ9 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms